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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005779`

染色体: Chr01 坐标: 73903939-73906440 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005779`
名称	SmilChr01G005779
描述	uncharacterized SmilChr01G005779
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73903939 - 73906440 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006087`
GeneID	`131006087`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006087`
原始查询	`LOC131006087`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831458]; symbol=AT5G16010; hit=AT5G16010; species=arabidopsis; confidence=high
产物	3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831458]; symbol=AT5G16010; hit=AT5G16010; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G16010` (AT5G16010) 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831458] identity=48.7; qcov=1.01; evalue=2.35e-90; confidence=high
Rice	`Os07g0162100` (OJ1714_H10.144) - identity=47.5; qcov=0.924; evalue=8.1e-65; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016627 (oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors)
KEGG	-
Pfam	PF02544 (Steroid_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006087

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057789213.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057789213.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789213.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789213.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73904207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C15,C56,C65,C77,D7
`Chr1:73904230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:73904264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C73
`Chr1:73905883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:73905892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B66,C32,C68,C82
`Chr1:73905943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B81
`Chr1:73905990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B127
`Chr1:73906130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:73906203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B52,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789213.1

264 aa

132

264

Steroid_dh

PF02544 Steroid_dh 125-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789213.1`	Pfam	`PF02544`	Steroid_dh	Family	125	264	1.8e-28	100.1	3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933230.1
TAAAGATTTAAAATACACCAATCATATAAGATCTGTGACATGGCCGGTGACGGCGGCGCCACCGCACCAACGCCGTCACACAAATTGTCTACAAATACCGCAGCGCTAAGATCTGCTGCTTGAACACTTGTGCACATAAATAAACACTGTGTGCTGCTCAAGGAGATTAAATCATTGAGAGAGAGAGAGAGATTATGGCAGAGATGATTGAAGCTTTTGTGTACAAGGAATCCTTATCGATTTACGAGAAATGCATTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006087
ATGGCAGAGATGATTGAAGCTTTTGTGTACAAGGAATCCTTATCGATTTACGAGAAATGCATTTGCGCGGCGACGCTTTTCTACATCCTCGGTTTAGCCGTTCTAGAAGTTTCCGGGAAGCATCTGCAGTACTCCAAATTCTGGAATTTGGGATCCAATAAGTCTTCGAAATCTGTGGTTTCGAGTAAGGTCGGGATGCTGATTATCTACACGCCGGCGTTATTCGCCGGCGTCTCCTCATTCTGGATCTTCCCCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789213.1
MAEMIEAFVYKESLSIYEKCICAATLFYILGLAVLEVSGKHLQYSKFWNLGSNKSSKSVVSSKVGMLIIYTPALFAGVSSFWIFPGGGIRFLMLKSAVTIHFLKRDLEVLFLHKFSGFFVVESAVIISATYFTAAAGFVYFHHQTRGLPEPTVDLKYLGAVLSLVGLSGNLYHHYLLSKLRKKDGKGYEIPRGGLFNLVVCPHYLFEITTFVGFSFISQTMFAYACAVGVAFYLLGRSHATRKWYVSKFENFPKNVKALI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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