当前解析结果
SmilChr01G005795| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005795 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005795 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005795 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 74040133 - 74042302 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006102 |
|---|---|
| GeneID | 131006102 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006102 |
| 原始查询 | LOC131006102 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006102 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057789233.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057789233.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789233.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789233.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789233.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:74041346 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B29 |
Chr1:74041418 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C32,C68,C82 |
Chr1:74041429 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,A8,B1,B138,B89 |
Chr1:74041445 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B43 |
Chr1:74041448 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr1:74041476 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C32,C68,C82 |
Chr1:74041620 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B43 |
Chr1:74041718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B3 |
Chr1:74041740 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr1:74041757 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr1:74041764 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C69 |
Chr1:74041808 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。