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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005796`

染色体: Chr01 坐标: 74042569-74044059 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005796`
名称	SmilChr01G005796
描述	F-box protein CPR1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74042569 - 74044059 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006103`
GeneID	`131006103`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006103`
原始查询	`LOC131006103`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein CPR1-like
产物	F-box protein CPR1-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=33.8; qcov=0.454; evalue=2.01e-10; confidence=low
Rice	`Os09g0479100` (OsFbox492) - identity=19.5; qcov=0.629; evalue=5.18e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006103

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789234.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789234.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789234.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789234.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74042739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B128
`Chr1:74042756`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	B115,B127,B130,B139,B31,B33,B38,B55,B63,B67,B71,B97,C19,C27,C31,C5,C60,C77,C81,D10
`Chr1:74042759`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B133,B136,C5
`Chr1:74042759`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B133,B136,C5
`Chr1:74042761`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	B115,B127,B130,B139,B31,B33,B38,B55,B63,B67,B71,B97,C19,C27,C31,C5,C60,C77,C81,D10
`Chr1:74042807`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	C32,C78,C84
`Chr1:74042807`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	C32,C78,C84
`Chr1:74042811`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C32,C78,C84
`Chr1:74042811`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C32,C78,C84
`Chr1:74042879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B57,B86,C18,C74
`Chr1:74042880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B41
`Chr1:74042889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B28,C25,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789234.1

326 aa

163

326

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 48-199 aa PF07734 FBA_1 53-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789234.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	48	199	1e-08	35.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057789234.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	53	259	3.3e-17	63.2	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933251.1
CTCTCTAGATCATCGCATACTCTTTTTCCTCCACCGCCTGAAACCCTAGGCTCAGCCTCCCTCTCCGCGAACTCCGGCGAAGTCGCAGCTATCAGCCCAGCCGTGTCTCCTCCCCTCTTTTGCTCTGATTCTGATCGGCCGCCGTAACTCCTCTCTTCTTATACAACTCCAACCTTCAATACATCTTTACCAATCAAATTCTTCTCTCTCACGCTATAAAAAAAAATGGACGACGTCGTTTTTGCGACGCGATTGAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006103
ATGGACGACGTCGTTTTTGCGACGCGATTGAATGGCAGTGCGAATGGCTGTCAATATTTAAAGGCTATTTGCCCAGATGGTGATGATGACCACTGGGATGGTTTCTTTCTTGACCTTTCATTTATGGGCGAATTTGACCATGAATGTTACATTGAGGCTAGTTATTGTGGTGGGATTTTCTGTTTCAATGCTTTTAATGGTCGGATTGCTCTTTGCAACCCGTTTGCTAACACCGTGAAATTCCTTCCCCCGCCCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789234.1
MDDVVFATRLNGSANGCQYLKAICPDGDDDHWDGFFLDLSFMGEFDHECYIEASYCGGIFCFNAFNGRIALCNPFANTVKFLPPPLLAPPSSYISFYNCGFGYDFTSDDYKVIRIFDVVKYNMEDHYSFSGATRKCELFSFKRNSWKEIESEGSSFLCADGGYALVDCSYHWLAVNSILAFNFSEEIFSYISLPPSFNVRSFNGDTPVCHVVVTPNYRLGVIFYSRVGESKTFQVWEYGIDEVWSKLYNDDAIISNVDKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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