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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005801`

染色体: Chr01 坐标: 74087947-74093377 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005801`
名称	SmilChr01G005801
描述	glutathione synthetase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74087947 - 74093377 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006109`
GeneID	`131006109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006109`
原始查询	`LOC131006109`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione synthetase, chloroplastic
产物	glutathione synthetase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G27380` (GSH2) glutathione synthetase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832797] identity=68.8; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0528400` (OsGS3) - identity=67.5; qcov=0.857; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004363 (glutathione synthase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006750 (glutathione biosynthetic process); GO:0043295 (glutathione binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03199 (GSH_synthase); PF03917 (GSH_synth_ATP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789245.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057789245.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057789245.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789245.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74088225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,C11,C69,D3
`Chr1:74088239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B128,B42,B43,C14
`Chr1:74088255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,D5
`Chr1:74089147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:74089256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B33,B9,C19,C60
`Chr1:74089674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C2,C5,C8
`Chr1:74089685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:74090038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr1:74090054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:74090057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B131,C26,C65
`Chr1:74090091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:74091160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,B74,B91,C51,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789245.1

531 aa

266

531

GSH_synth_ATP

GSH_synthase

PF03917 GSH_synth_ATP 71-530 aa PF03199 GSH_synthase 263-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789245.1`	Pfam	`PF03917`	GSH_synth_ATP	Domain	71	530	2.2e-128	428.9	Eukaryotic glutathione synthase, ATP binding domain
`XP_057789245.1`	Pfam	`PF03199`	GSH_synthase	Domain	263	363	1.1e-34	119.8	Eukaryotic glutathione synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933262.1
TGCACTTTTTTTTGACTGGAAATCTTTGAGTGGTAAAGGTGTGAAGGCTTTTCTGTTACTGAACTCAATTTTGCTTCCAACTAAACAGCACTGGTCCACAGTAGTCAATAGTCATCACCACTCAATGAGAAATTGACATCAAATTCATCAACCATTTTCTCAATTATGCTAAAGCAGTTTCAGGTTTTGGGAGTGGAGGAAAGTGTCTGCTTCTCGAATTGCTCCCAACAGAAACGAAGGAGATCTCGAGCTCACAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006109
ATGCTAAAGCAGTTTCAGGTTTTGGGAGTGGAGGAAAGTGTCTGCTTCTCGAATTGCTCCCAACAGAAACGAAGGAGATCTCGAGCTCACAATTCGAAGCCCTGCAATATTCCCATGGCCCAGAATGCTTCTTCACCGCTTCCGCCATTGAAGTGCGAAGCCAAGCCCCAAAACCCCGTGTTTGATCCTCACGGTTTAGACCCTAATCTGCTGCAGAGAATCGCGTATGATGCTCTGGTTTGGAGCTCTCTTCGCGGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789245.1
MLKQFQVLGVEESVCFSNCSQQKRRRSRAHNSKPCNIPMAQNASSPLPPLKCEAKPQNPVFDPHGLDPNLLQRIAYDALVWSSLRGLLVGDRASQKSGTVPGVGLVHAPISLLPMPFPESHWKQACEVAPIFNELVDRVSLDSKFIQDSLSRTKKVDAFTSRLLDIHAKMLDMNKKEDIRLGLHRSDYMLDGQTNLLLQIELNTISSSFPGLSCLVSDLHRSLLHQFKQHLVLDPERIPKNDSANQFVEALHKAWSEYNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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