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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005804`

染色体: Chr01 坐标: 74100729-74103443 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005804`
名称	SmilChr01G005804
描述	dnaJ protein homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74100729 - 74103443 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006113`
GeneID	`131006113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006113`
原始查询	`LOC131006113`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dnaJ protein homolog
产物	dnaJ protein homolog
Arabidopsis	`AT5G22060` (J2) DNAJ homologue 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832267] identity=78; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0648400` (OsDjA4) - identity=85.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0009408 (response to heat); GO:0030544 (Hsp70 protein binding); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF00684 (DnaJ_CXXCXGXG); PF01556 (DnaJ_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789252.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789252.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789252.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057789252.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789252.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74101198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C5,C8,C85
`Chr1:74101810`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B3,B56
`Chr1:74101810`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B3,B56
`Chr1:74101962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B128
`Chr1:74102117`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B90
`Chr1:74102117`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B90
`Chr1:74102122`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B90
`Chr1:74102122`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B90
`Chr1:74102149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:74102551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,D11
`Chr1:74102565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C79
`Chr1:74102823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789252.1

420 aa

210

420

DnaJ

DnaJ_C

DnaJ_CXXCXGXG

PF00226 DnaJ 13-71 aa PF01556 DnaJ_C 125-345 aa PF00684 DnaJ_CXXCXGXG 150-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789252.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	13	71	5.2e-24	84.8	DnaJ domain
`XP_057789252.1`	Pfam	`PF01556`	DnaJ_C	Domain	125	345	5e-37	128.0	DnaJ C terminal domain
`XP_057789252.1`	Pfam	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	Domain	150	216	1.4e-15	58.0	DnaJ central domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933269.1
CGACAAAAGCTCTAGAATATTCGAGAGTCTTCCTTGGTAGGCGATTTGCTCTCGACTAATCTCAGCCGTCCAAAACCTCTTTCCCTCACTTAAAACCGCAGATCTACTCTGACCTAATCTCTCTCTCTCTCTCCTTCGCTCTAGCTTCGCCGCACCTCCGCAACTCCGATTCTCAGCTAGTATAAAGAGCAGCAGAGATGTTTGGGAGAGCGCCGAAGAAAAGCGATAATACCAAATACTATGAGGTATTGGGTGTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006113
ATGTTTGGGAGAGCGCCGAAGAAAAGCGATAATACCAAATACTATGAGGTATTGGGTGTGTCGAAGAATGCTTCGCAGGACGATCTGAAGAAGGCGTATCGTAAATCCGCAATTAAAAATCATCCTGATAAAGGCGGAGATCCGGAAAAGTTTAAAGAGATTGCCCAAGCATATGAAGTATTGAGTGATCCAGAGAAGCGTGAGATCTATGATCAGTATGGTGAGGATGCTCTCAAGGAAGGAATGGGTGGTGGAGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789252.1
MFGRAPKKSDNTKYYEVLGVSKNASQDDLKKAYRKSAIKNHPDKGGDPEKFKEIAQAYEVLSDPEKREIYDQYGEDALKEGMGGGGGQGHNPFDIFESFFGGGNPFGGGGSSRGRRQRRGEDVIHPLKVSLDDLYNGTSKKLSLSRNVLCPKCKGKGSKSGASMKCAGCQGSGMKVSIRHLGPSMIQQMQHPCNECKGTGETISDKDRCPQCKGEKVTQEKKVLEVVVEKGMQHGQKITFPGEADEAPETVTGDIVFVLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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