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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005840`

染色体: Chr01 坐标: 74405949-74410092 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005840`
名称	SmilChr01G005840
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74405949 - 74410092 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006136`
GeneID	`131006136`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006136`
原始查询	`LOC131006136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=31.1; qcov=0.433; evalue=2.03e-15; confidence=low
Rice	`Os03g0579200` - identity=32; qcov=0.495; evalue=1.06e-15; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006136

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057789286.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789286.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789286.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789286.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74408093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A14,A6,C87
`Chr1:74408113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C87
`Chr1:74408124`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A10,A14,A19,A20,B102,B105,B106,B115,B119,B121,B128,B131,B133,B138,B20,B24,B27,B28,B34,B44,B45,B49,B57,B67,B82,B84,B92,C29,C3,C36,C39,C46,C48,C56,C57,C59,C6,C65,C72,C73,C75,C81,C83,C85
`Chr1:74408125`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A6,B32,C22
`Chr1:74408125`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A6,B32,C22
`Chr1:74408129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C22
`Chr1:74408131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B74,C60
`Chr1:74408135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B120,B80,C4,C87
`Chr1:74408149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C87
`Chr1:74408197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B58,C24,D5
`Chr1:74408271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:74408375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789286.1

416 aa

208

416

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 233-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789286.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	233	393	1.8e-27	96.7	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933303.1
ACTTGACAACTGCCGTTTTGTCACAGCCGGCAACCAGAGAGGAATGACGGCTTATGGTGCAGTGAATTCTCTGAGGAATACAATTGATTATATTCTCCATTCTTCTCATTTTATCCTCGTTGATCCCTCTCCACGTATCTTACAACTCGCGGACGAGGAGTTGGATCCATTGCAAGAAATTCTGGAAAGTTTGGACAGGACAAGAACAAGCAAGAGCAGGAAGAAGGTGAATGGTTTGGATGGAAGAATCAAAGATTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006136
ATGACGGCTTATGGTGCAGTGAATTCTCTGAGGAATACAATTGATTATATTCTCCATTCTTCTCATTTTATCCTCGTTGATCCCTCTCCACGTATCTTACAACTCGCGGACGAGGAGTTGGATCCATTGCAAGAAATTCTGGAAAGTTTGGACAGGACAAGAACAAGCAAGAGCAGGAAGAAGGTGAATGGTTTGGATGGAAGAATCAAAGATTTGATTTGGGAATTCGAGGACGCGTTGGAATCCCTTCTCTACCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789286.1
MTAYGAVNSLRNTIDYILHSSHFILVDPSPRILQLADEELDPLQEILESLDRTRTSKSRKKVNGLDGRIKDLIWEFEDALESLLYQQILSQVEDEGVMEEEAWESRGFTITTTTTRRVLHKHEARIMRESQASQSRSLEDEGMKEGSWGFQHLLDSLLFESPPLHHTTTTTRRIGFSIDLQFLQHHVPSFIERLKDMEEEYIYEVDNMPEDDDEEESIYTRRRTKSKMIGLSDQIQQLKEDIMQSCDNMNFALVGTAGVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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