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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005824`

染色体: Chr01 坐标: 74240207-74241430 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005824`
名称	SmilChr01G005824
描述	putative disease resistance protein At1g58400
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74240207 - 74241430 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006140`
GeneID	`131006140`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006140`
原始查询	`LOC131006140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g58400
产物	putative disease resistance protein At1g58400
Arabidopsis	`AT1G58400` (AT1G58400) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842209] identity=36.8; qcov=0.5; evalue=6.9e-10; confidence=low
Rice	`Os11g0687900` - identity=30; qcov=0.46; evalue=6.05e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006140

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789292.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789292.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789292.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789292.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74240418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:74240520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:74240561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:74240578`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B10,B122,B50,B94,C1,D6
`Chr1:74240596`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C79
`Chr1:74240596`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C79
`Chr1:74240598`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A11,B102,B126,B128,B131,B22,B24,B30,B33,B47,B54,B86,B89,C14,C28,C38,C5,C61,D1
`Chr1:74240601`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A11,B102,B126,B128,B131,B22,B24,B30,B33,B47,B54,B86,B89,C14,C28,C38,C5,C61,C79,D1
`Chr1:74240619`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B110,B12,B77,B94,C44,C45,C63
`Chr1:74240638`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B110,B12,B77,B94,C45
`Chr1:74240638`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B110,B12,B77,B94,C45
`Chr1:74240655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B12,B77,B94,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789292.1

174 aa

174

Rx_N

PF18052 Rx_N 5-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789292.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	93	3.5e-16	59.8	Rx N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933309.1
ATCGGGGCTATTCAATAGAATTACCCTTATATGTCTTGTGTTGTCTTGAAAAACTCTACACGCGTGTTTATATGCTTTCCACTGTGTGTGTCTCTCCCCTTTGAGAATTGAGATGGGGGAGGCTGCAGTGAGTTTCTTGCTGGAGCAACTGAAGGGGGTGGTGACAGAGTACAAAGAGCACATCTCCGGAGCAGAAAGTGATTTCGACGAGCTGAAGAACGAGCTTGGTATGCTCAAGGCTTTCCTCAAGGACGCGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006140
ATGGGGGAGGCTGCAGTGAGTTTCTTGCTGGAGCAACTGAAGGGGGTGGTGACAGAGTACAAAGAGCACATCTCCGGAGCAGAAAGTGATTTCGACGAGCTGAAGAACGAGCTTGGTATGCTCAAGGCTTTCCTCAAGGACGCGGCCATGGCGACGAAGCAGGAGCAACTATTCAAAGAAATGCAGAAGCAGATAATAGAGGTCATCTACGAGGTCGAAGACACCATTGATACTTGCCTGTCCAAGGCTATCGAGGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789292.1
MGEAAVSFLLEQLKGVVTEYKEHISGAESDFDELKNELGMLKAFLKDAAMATKQEQLFKEMQKQIIEVIYEVEDTIDTCLSKAIEAKAKSKRHCLSKSTKSISLFREVNSIREEKVLPMFKRAKTMFSMMQIGDGSGAVDDQRTKLKRNVQDRDKMVGNFGEGGGSAGEGDDLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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