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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005853`

染色体: Chr01 坐标: 74482941-74485901 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005853`
名称	SmilChr01G005853
描述	ribonuclease H2 subunit A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74482941 - 74485901 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006154`
GeneID	`131006154`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006154`
原始查询	`LOC131006154`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribonuclease H2 subunit A
产物	ribonuclease H2 subunit A
Arabidopsis	`AT2G25100` (AT2G25100) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817048] identity=74.6; qcov=0.973; evalue=2.76e-167; confidence=high
Rice	`Os11g0153900` (RbH) - identity=72.8; qcov=0.973; evalue=3.59e-159; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity); GO:0006298 (mismatch repair); GO:0032299 (ribonuclease H2 complex); GO:0043137 (DNA replication, removal of RNA primer)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01351 (RNase_HII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006154

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789308.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057789308.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057789308.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057789308.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74483095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:74484075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:74484218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B65
`Chr1:74485362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr1:74485722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,B98
`Chr1:74485734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B29,C2,C23,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789308.1

299 aa

150

299

RNase_HII

PF01351 RNase_HII 21-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789308.1`	Pfam	`PF01351`	RNase_HII	Domain	21	230	2.3e-51	175.2	Ribonuclease HII

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933325.1
TTTATTTATTTATTTATTTTTTATAAAAGAGAAAAAGAAAATACAAACTGAGGCAAGCAGCTGAAGACTGAAAGAGCGCGAAAACCCCTCTTTGTGGCGGGGAAAAGAAGGAAACCATAACGATGGGATCGGAGGCGCCGCCGCCGCCGCTGCTGCCGGAATGGGCGTCAGAGCCCTGCATAATGGGCATTGATGAAGCTGGCCGTGGCCCTGTGTTAGGTCCAATGGTCTATGGATGCTTGTATTGTGCGCTATCCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006154
ATGGGATCGGAGGCGCCGCCGCCGCCGCTGCTGCCGGAATGGGCGTCAGAGCCCTGCATAATGGGCATTGATGAAGCTGGCCGTGGCCCTGTGTTAGGTCCAATGGTCTATGGATGCTTGTATTGTGCGCTATCCTATCAAAAAACGCTCTCCACCTTGAGTTTTGCAGACTCAAAAACTTTAAAAGAAGAGAAGAGGGAAGAGTTATTTGAGAATTTGAAGGCTGATGAATCAATCGGATGGGCTGTTGATGTCATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789308.1
MGSEAPPPPLLPEWASEPCIMGIDEAGRGPVLGPMVYGCLYCALSYQKTLSTLSFADSKTLKEEKREELFENLKADESIGWAVDVIDPRELSDKMLRKNKINLNEISHESAMGLIRKALNLGVLLTEVYLDTVGDTEKYRVKLSERFPNIKFVVAKKADSLYPVVSGASIVAKVTRDRALRDWMPDETADLSRNFGSGYPGDPQTKSWLEDHKHSVFGFPSLVRFSWGTCMSYSKDFVDVLWESDAADEDDSGKSSKRQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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