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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005860`

染色体: Chr01 坐标: 74524119-74526283 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005860`
名称	SmilChr01G005860
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74524119 - 74526283 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006160`
GeneID	`131006160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006160`
原始查询	`LOC131006160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G33020` (RLP24) receptor like protein 24 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817864] identity=37.9; qcov=0.986; evalue=5.34e-95; confidence=medium
Rice	`Os12g0222800` - identity=38.1; qcov=1.04; evalue=2.93e-89; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8); PF24141 (LRR_ComC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789318.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789318.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789318.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789318.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789318.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74524374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B16,B52,C69
`Chr1:74524509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C15,C40
`Chr1:74524550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr1:74524565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr1:74524566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr1:74524578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:74524616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B26
`Chr1:74524619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C28
`Chr1:74524701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C42
`Chr1:74524861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B91
`Chr1:74524949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:74524963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789318.1

485 aa

242

485

LRR_ComC

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF24141 LRR_ComC 9-87 aa PF13855 LRR_8 14-53 aa PF00560 LRR_1 18-40 aa PF00560 LRR_1 42-64 aa PF00560 LRR_1 67-88 aa PF00560 LRR_1 91-112 aa PF00560 LRR_1 140-161 aa PF00560 LRR_1 214-231 aa PF00560 LRR_1 280-300 aa PF13855 LRR_8 280-337 aa PF00560 LRR_1 303-324 aa PF00560 LRR_1 327-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF24141`	LRR_ComC	Repeat	9	87	9.6e-10	39.3	EGF-like domain-containing protein ComC LRR domain
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	14	53	1.6e-28	99.0	Leucine rich repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	18	40	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	42	64	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	67	88	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	91	112	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	140	161	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	214	231	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	280	300	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	280	337	1.6e-28	99.0	Leucine rich repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	303	324	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057789318.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	327	348	5.1e-38	121.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933335.1
AGGAAAAATACTTTTGTGTCAAATGTTAGAAAATAAATGAGACATTTGAAAGCATAAATTTTTGTTTCTTTTCAATTGGAACCATCTTCAGCACTCGTCTCTTTATCCTAAAAGATGGAAGCACTAAATCTTTTATTCCTTGGAAACAATGACTTTGACTCTAGGACGCAAACATTAAAAGGTTCATAAATTAGGGTGATAAGTAATATTTTCCCTATACGTCTCAATCTAGAATTAGACTAACTCTTTGTGATGATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006160
ATGATTTGGATATTTGTAGGAGTTATTCCACAAGAGATACATCATCTTCATAATTTAACAGTATTGGACTTGAGTTCGAACAAGTTATCAGGCACCTTGCCACCAACCATTTTCAACATGTCTTCCTTGGCATGGATTGACTTATCAAGTAACACACTTAGCGGGGCATTGCCTTCAGAAATTGGGAACATGAAAGCACTATCTACTTTAGTACTTCAGAACAATGCCTTAACCGGTACTATTCCATCCTCCATCTGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789318.1
MIWIFVGVIPQEIHHLHNLTVLDLSSNKLSGTLPPTIFNMSSLAWIDLSSNTLSGALPSEIGNMKALSTLVLQNNALTGTIPSSICNLTSLGFLVLSNNTLEGTIPQCFGNLSKSLLIFHLNVNQFSGLIPSSFSKGCGLVSINLNGNKLQGPLPKSLINCQRLQDLDVGNNRIQDEFPFWMEVLLDLQVLVLRANKFYGNMSIPSQTKIPFHNLQVLDISQNRFVGSLPQGYFKNFKAMIEVNETSLSTNDTFFKYYVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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