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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001671`

染色体: Chr01 坐标: 30819665-30820468 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001671`
名称	SmilChr01G001671
描述	uncharacterized SmilChr01G001671
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30819665 - 30820468 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006169`
GeneID	`131006169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006169`
原始查询	`LOC131006169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41220` (GSTT3) glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=30.3; qcov=0.693; evalue=3.96e-14; confidence=low
Rice	`Os08g0225900` - identity=30.6; qcov=1.1; evalue=6.84e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789331.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789331.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789331.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789331.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30819677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B103,C1
`Chr1:30819677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C1
`Chr1:30819701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B123,B64,B71,C47,C60,C86,D11
`Chr1:30819707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,C10,C14,C5,C55
`Chr1:30819726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr1:30819737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr1:30819740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,D6
`Chr1:30819746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	88	A11,A18,A21,A3,A5,A6,A9,B103,B104,B110,B12,B120,B124,B130,B134,B136,B16,B18,B2,B21,B24,B29,B31,B34,B35,B37,B40,B41,B44,B5,B51,B52,B53,B55,B63,B69,B72,B73,B74,B75,B76,B83,B85,B86,B87,B91,B92,B93,B94,B95,C1,C10,C11,C12,C16,C18,C2,C21,C22,C24,C28,C29,C33,C35,C36,C39,C44,C46,C52,C55,C56,C59,C63,C64,C67,C69,C7,C70,C72,C75,C79,C80,C82,C83,D1,D2,D6,D8
`Chr1:30819757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:30819774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:30819803`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	124	A11,A16,A18,A21,A24,A3,A5,A6,A9,B100,B101,B103,B104,B106,B110,B113,B12,B120,B124,B127,B130,B131,B134,B135,B136,B139,B16,B18,B19,B2,B21,B24,B27,B29,B3,B31,B34,B35,B37,B40,B41,B44,B5,B51,B53,B55,B56,B59,B63,B65,B68,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B90,B91,B92,B93,B94,B95,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C28,C29,C32,C33,C35,C36,C37,C39,C4,C44,C46,C48,C52,C53,C55,C56,C59,C62,C63,C64,C65,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C86,D1,D11,D2,D3,D6,D8
`Chr1:30819806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B103,B115,C1,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933348.1
ATGTCTAATCCTCAAGTATATCCCAATCCCATTAGTCAATCAGCCCCTTCATTTCAATTTTCATCCCAAGGGCATCCGTCTCAAGGGTTTCAGCCATACGGATATCCCCCGCAATGGTATCCCCCTCCAGGATTTTCCCTGCAAGGATATCCTTCGCAGGGGTATATGTTCTCTGAGTCCTCTAGGAGGACAAGTGTAGATGGGAGTTGTACTGATGGAGGCACACCATCTTCAAGAAGGGCAGTTCAAGGTTTGGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006169
ATGTCTAATCCTCAAGTATATCCCAATCCCATTAGTCAATCAGCCCCTTCATTTCAATTTTCATCCCAAGGGCATCCGTCTCAAGGGTTTCAGCCATACGGATATCCCCCGCAATGGTATCCCCCTCCAGGATTTTCCCTGCAAGGATATCCTTCGCAGGGGTATATGTTCTCTGAGTCCTCTAGGAGGACAAGTGTAGATGGGAGTTGTACTGATGGAGGCACACCATCTTCAAGAAGGGCAGTTCAAGGTTTGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789331.1
MSNPQVYPNPISQSAPSFQFSSQGHPSQGFQPYGYPPQWYPPPGFSLQGYPSQGYMFSESSRRTSVDGSCTDGGTPSSRRAVQGLENINLSIEPKSDDDEQNANKHRVFYSDAECEVLAQCWIDITINSVVENDQKLEKIWKRIAEAYNKNRPTNTPRREPTQLKAHFYKLQKHVKLFFECYKRIASIWRSGTNDADIIETTQTKYKQHHGTNGFKYVGVWRILSNVPKFVEVEGNVQASKRTKNTEEGAYTSSSTAEET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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