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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005882`

染色体: Chr01 坐标: 74749569-74756877 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005882`
名称	SmilChr01G005882
描述	probable sodium/metabolite cotransporter BASS4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74749569 - 74756877 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006176`
GeneID	`131006176`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006176`
原始查询	`LOC131006176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sodium/metabolite cotransporter BASS4, chloroplastic
产物	probable sodium/metabolite cotransporter BASS4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G56160` (AT3G56160) Sodium Bile acid symporter family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824782] identity=61.1; qcov=0.932; evalue=7.68e-145; confidence=high
Rice	`Os02g0531200` (BASS4) - identity=66.6; qcov=0.781; evalue=1.19e-137; confidence=high
GO	GO:0009941 (chloroplast envelope)
KEGG	-
Pfam	PF01758 (SBF); PF13593 (SBF_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006176

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789336.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057789336.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789336.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789336.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74749947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D3
`Chr1:74749949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr1:74750125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B132
`Chr1:74750142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:74750981`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A15,A23,A7,B136,B21,B4,B5,B58,B69,B77,B82,B95,C21,C45,C49,C50,C64,C66,C83
`Chr1:74751593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C40
`Chr1:74751738`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	B1,B107,B129,B23,B3,B40,B6,C11,C22,C62,C63,C67,C69,C70
`Chr1:74751764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:74752042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:74752095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,C27,C51,C73,C8
`Chr1:74752130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:74752423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B53,C22,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789336.1

430 aa

215

430

SBF_like

SBF

PF13593 SBF_like 97-418 aa PF01758 SBF 136-296 aa

XP_057789337.1

425 aa

212

425

SBF_like

SBF

PF13593 SBF_like 97-413 aa PF01758 SBF 136-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789336.1`	Pfam	`PF13593`	SBF_like	Domain	97	418	5.8e-45	154.6	SBF-like CPA transporter family (DUF4137)
`XP_057789336.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	136	296	8.5e-12	45.9	Sodium Bile acid symporter family
`XP_057789337.1`	Pfam	`PF13593`	SBF_like	Domain	97	413	1.1e-45	157.0	SBF-like CPA transporter family (DUF4137)
`XP_057789337.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	136	294	3.3e-12	47.2	Sodium Bile acid symporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933354.1
GCGCTCTCGCTGTTCGTGCCGCAGGGCGGGACGGCGATACTGGTCGTGACGGGGGTGTTCGTGGTCTGGGCGACGCGTGTCTGCACGGGATTGGTCGTGGAGCTCGCGAGCTGCGGGGACGAGCACCGGGGACTCATCACTCACACCCACCATGGCGCGAGCACTCCAAGCCCTAATCCCCCACACTCCGATCACCGGAATTCCATCTTTCCGGCTTCTGCGCCAGCTTCCCTCGCCGGCGTTTTCCCCCATTCCCAACC...

XM_057933353.1
GCGCTCTCGCTGTTCGTGCCGCAGGGCGGGACGGCGATACTGGTCGTGACGGGGGTGTTCGTGGTCTGGGCGACGCGTGTCTGCACGGGATTGGTCGTGGAGCTCGCGAGCTGCGGGGACGAGCACCGGGGACTCATCACTCACACCCACCATGGCGCGAGCACTCCAAGCCCTAATCCCCCACACTCCGATCACCGGAATTCCATCTTTCCGGCTTCTGCGCCAGCTTCCCTCGCCGGCGTTTTCCCCCATTCCCAACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006176
ATGGCGCGAGCACTCCAAGCCCTAATCCCCCACACTCCGATCACCGGAATTCCATCTTTCCGGCTTCTGCGCCAGCTTCCCTCGCCGGCGTTTTCCCCCATTCCCAACCGCAAGTCCAATGTAGCGCCTTGTGTTTGGGAGCTCCATTCAGTTTATAGAATACGCTGCATTAAAGCAAGTGCCAAGTCCCTCGAGGGAAATGGAGATGGAGAAGAAGAAAAGCCGCTCCCAGTGGTTGTAACTTCGAATTGGACTAAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789336.1
MARALQALIPHTPITGIPSFRLLRQLPSPAFSPIPNRKSNVAPCVWELHSVYRIRCIKASAKSLEGNGDGEEEKPLPVVVTSNWTKTLANVASDNFLPLALICGVLLGLANPGPGCLADKLYVSKISTFGIFVISGLTLRSDEIGAATEAWPVGLFGLASILFFTPLFSKIILMLKLQPQEFVTGLAIFCCMPTTLSSGVALTRLAGGNSALALAMTLISNLLGILIIPYSISKFIAAGVGVAIPTEQLLRSLVLTLLVP...

XP_057789337.1
MARALQALIPHTPITGIPSFRLLRQLPSPAFSPIPNRKSNVAPCVWELHSVYRIRCIKASAKSLEGNGDGEEEKPLPVVVTSNWTKTLANVASDNFLPLALICGVLLGLANPGPGCLADKLYVSKISTFGIFVISGLTLRSDEIGAATEAWPVGLFGLASILFFTPLFSKIILMLKLQPQEFVTGLAIFCCMPTTLSSGVALTRLAGGNSALALAMTLISNLLGILIIPYSISKFIAAGVGVAIPTEQLLRSLVLTLLVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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