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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001676`

染色体: Chr01 坐标: 30953499-30955453 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001676`
名称	SmilChr01G001676
描述	uncharacterized SmilChr01G001676
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30953499 - 30955453 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006188`
GeneID	`131006188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006188`
原始查询	`LOC131006188`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0125300` - identity=24.7; qcov=0.878; evalue=2.17e-16; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13976 (gag_pre-integrs); PF22936 (Pol_BBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789354.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789354.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789354.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789354.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30953504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A4,B104,B108,B113,B33,B42,B83,C10,C50,C62,C77,C79
`Chr1:30953522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B4,B57,C36,C37,C42
`Chr1:30953522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B57,C36,C37,C42
`Chr1:30953523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C40
`Chr1:30953530`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A18,B2,C59
`Chr1:30953530`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A18,B2,C59
`Chr1:30953531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	204	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B135,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B43,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr1:30953535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B2,C59
`Chr1:30953543`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr1:30953543`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr1:30953545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B2,C59
`Chr1:30953552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789354.1

304 aa

152

304

Pol_BBD

gag_pre-integrs

PF22936 Pol_BBD 142-200 aa PF13976 gag_pre-integrs 238-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789354.1`	Pfam	`PF22936`	Pol_BBD	Domain	142	200	9.2e-10	39.4	Pol polyprotein, beta-barrel domain
`XP_057789354.1`	Pfam	`PF13976`	gag_pre-integrs	Domain	238	304	1.4e-12	48.0	GAG-pre-integrase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933371.1
ATGACTGAAGGGTTTAACAAGATGGAGTCGAGGTTCATAAAGTATAAGAAGTTCCACAAGAAGAACTTCAAAGGCAAGGAGAAGGAGTACAAGCTAAGATACTCCAAGTCCAACGATAAATTCGAAGAGAAGAAGCCATCTACTCCAGACTTGAAGGATGTGAAGTGTTTTGGCTGCGACAAGAAGGGACACTACAAGACTGGTTGTCCTGAGATTTCATACTTAGAACGAAAAGCCCTTCGAGCCAAAAGAGATTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006188
ATGACTGAAGGGTTTAACAAGATGGAGTCGAGGTTCATAAAGTATAAGAAGTTCCACAAGAAGAACTTCAAAGGCAAGGAGAAGGAGTACAAGCTAAGATACTCCAAGTCCAACGATAAATTCGAAGAGAAGAAGCCATCTACTCCAGACTTGAAGGATGTGAAGTGTTTTGGCTGCGACAAGAAGGGACACTACAAGACTGGTTGTCCTGAGATTTCATACTTAGAACGAAAAGCCCTTCGAGCCAAAAGAGATTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789354.1
MTEGFNKMESRFIKYKKFHKKNFKGKEKEYKLRYSKSNDKFEEKKPSTPDLKDVKCFGCDKKGHYKTGCPEISYLERKALRAKRDFIFSLRISWKKIKDWRKRSVKLGLKRKRPVSTFRMKLGKTKKQNKKKEEAKAPNNTWYLDCGCSKHMTGCKEYLTQYVEKAGSKVVFGDNSLGETKGYSELNMGNVCISNVSYVSLSVSQFCDSGFSVKIKRDEFTVRNNNKKEVLNGVRQGKLYVVSWEDSSPETCLISKSHAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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