当前解析结果
SmilChr01G005901| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005901 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005901 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005901 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 74908443 - 74909244 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006192 |
|---|---|
| GeneID | 131006192 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006192 |
| 原始查询 | LOC131006192 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006192 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057789356.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057789356.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789356.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789356.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789356.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:74908497 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A15,B1,B103,B105,B112,B119,B120,B129,B135,B18,B19,B27,B4,B46,B5,B50,B7,B77,B89,C15,C22,C28,C29,C35,C39,C45,C49,C50,C56,C60,C66,C79,C8,C83,C86,D3,D8 |
Chr1:74908510 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 155 | A10,A14,A15,A16,A19,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A8,B1,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B120,B121,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B135,B137,B138,B14,B140,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B26,B27,B28,B3,B34,B36,B37,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B51,B52,B54,B57,B58,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B89,B9,B94,C1,C12,C13,C16,C17,C18,C2,C21,C22,C25,C26,C28,C29,C32,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C45,C47,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C6,C61,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C71,C73,C74,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D6,D7,D8 |
Chr1:74908514 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 47 | A13,A16,A24,A4,B100,B110,B113,B118,B120,B127,B128,B13,B130,B135,B137,B14,B140,B16,B28,B36,B46,B47,B51,B52,B54,B57,B64,B69,B71,B73,B76,B78,B8,B86,B88,B94,C12,C16,C18,C4,C45,C52,C54,C55,C65,C73,D4 |
Chr1:74908518 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | A15,B1,B105,B120,C29,C66,C8,D8 |
Chr1:74908539 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B42 |
Chr1:74908621 |
G |
GTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A16,B4 |
Chr1:74908621 |
G |
GTT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | A16,B4 |
Chr1:74908622 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B1,B105,B57,C4,C55,C66 |
Chr1:74908677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B13 |
Chr1:74908706 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B35 |
Chr1:74908706 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr1:74908711 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A15,A23,B28,B39,B95,C3,C33,C5,C51,C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。