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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005905`

染色体: Chr01 坐标: 74922340-74924203 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005905`
名称	SmilChr01G005905
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74922340 - 74924203 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006194`
GeneID	`131006194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006194`
原始查询	`LOC131006194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI5
产物	probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI5
Arabidopsis	`AT2G31510` (ARI7) IBR domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817709] identity=43; qcov=1.07; evalue=1.39e-70; confidence=medium
Rice	`Os08g0540300` (P0666G10.134) - identity=42.5; qcov=0.925; evalue=2.05e-59; confidence=medium
GO	GO:0000151 (ubiquitin ligase complex); GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0031624 (ubiquitin conjugating enzyme binding); GO:0032436 (positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF01485 (IBR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789358.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057789358.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789358.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789358.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74922443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D5
`Chr1:74922453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr1:74922460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:74922476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,A3,B65,C1,C69
`Chr1:74922486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B105,B44,B71,C75
`Chr1:74922501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A2,B105,B44,B60,B71,C75
`Chr1:74922503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,A3,B65,C1,C69
`Chr1:74922512`	`CA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A25,A3,B65,C1,C69
`Chr1:74922552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B43,C28,C3,C47
`Chr1:74922563`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B43,C28,C3,C47
`Chr1:74922563`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B43,C28,C3,C47
`Chr1:74922576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B43,C28,C3,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789358.1

254 aa

127

254

zf-C3HC4

IBR

PF00097 zf-C3HC4 107-147 aa PF01485 IBR 176-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789358.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	107	147	2.9e-06	27.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057789358.1`	Pfam	`PF01485`	IBR	Domain	176	240	8.4e-16	58.5	IBR domain, a half RING-finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933375.1
CAAACCGTTTACAAAGTATTATAAATATACAAAACTAAATTTCATAATTTACACACGCCAAAGATTCCATGGATTCTGAAGGCGAGGGTTTCTACAGCAGCAGCAGTAGTGATGCGACGGCGGATGACAGTTTCGCCGATTACGCCGCCGTCAGCCGCCTCCAGAAACCCTACAAAATCCTAACAGAGGGCGACATCCAGCAACTCCTCGACGACGATATCTCCACAGTTTCCGACGTTCTCTCCGTCTCCCTCGGCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006194
ATGGATTCTGAAGGCGAGGGTTTCTACAGCAGCAGCAGTAGTGATGCGACGGCGGATGACAGTTTCGCCGATTACGCCGCCGTCAGCCGCCTCCAGAAACCCTACAAAATCCTAACAGAGGGCGACATCCAGCAACTCCTCGACGACGATATCTCCACAGTTTCCGACGTTCTCTCCGTCTCCCTCGGCGCCGCCTGCACCCTCCTCTGCCAGAATAATTGGAATCTCAGCTCCGTCTACGACAAATTTTTCGCCACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789358.1
MDSEGEGFYSSSSSDATADDSFADYAAVSRLQKPYKILTEGDIQQLLDDDISTVSDVLSVSLGAACTLLCQNNWNLSSVYDKFFATDDRNHQTAASSSQRELGQNLCKICYDEISPQNTVSATCGHPFCADCWITYVATAIDDCAGCLTLRCPEPGCGMAVGVDLIESLASTDSKEKYLRYLRQSYVESCRRRKWCPAPGCNFAVEFDGGGGGGGYDVTCGCSHKFCWNCGEEHHRPVGCETVANWSEKNNSEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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