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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001685`

染色体: Chr01 坐标: 31080667-31081688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001685`
名称	SmilChr01G001685
描述	uncharacterized SmilChr01G001685
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31080667 - 31081688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006208`
GeneID	`131006208`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006208`
原始查询	`LOC131006208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=39; qcov=0.438; evalue=4.99e-12; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=46; qcov=0.857; evalue=1.28e-78; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006208

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789374.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057789374.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789374.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789374.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31080668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:31080675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C57,C67
`Chr1:31080696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A1,A11,A14,A15,A2,A20,A22,B101,B108,B114,B122,B126,B13,B132,B16,B18,B27,B32,B41,B57,B59,B62,B65,B66,B75,B78,B8,B81,B83,B95,B99,C10,C13,C2,C23,C26,C3,C35,C39,C4,C45,C48,C57,C62,C64,C66,C7,C75
`Chr1:31080729`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A24,B120,B54,B58,B75,B92,C42,C83
`Chr1:31080751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B35,C71,D11
`Chr1:31080756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B126,C71,C74
`Chr1:31080760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A11,B101,B102,B103,B108,B11,B112,B115,B117,B128,B14,B140,B20,B28,B37,B40,B41,B44,B47,B64,B67,B71,B89,B9,B94,C1,C10,C14,C16,C17,C3,C41,C42,C50,C52,C55,C56,C6,C79,C82,D7
`Chr1:31080768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C38,C82
`Chr1:31080780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B100,B125,B74
`Chr1:31080836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C24,C38
`Chr1:31080856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B59,B65,C38,C82
`Chr1:31080876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B56,B96,C24,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789374.1

322 aa

161

322

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 76-115 aa PF04827 Plant_tran 166-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789374.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	76	115	7.3e-17	61.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057789374.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	166	322	6.5e-63	212.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933391.1
ATGCCATCATCCAACAATTCTTCAAATCATTTTTCCACCAATTCTTCATCTGACGAAGAAGTTCCAAACCCACAATTTTCTACTCTTCCCGATCCTATGCAAAATCCCGAAGGATTTTTTATGAGTCTTGCTGCAAATTTCATGCAAGTGGCGAGTTCATATCAATTCGATCCTCCTCATCTACCGATGAAGAAGCGTAAAGTTATTCTCCGTGATCGTGAAGGTGGTGGTGAGCGCCTTCATCGGGATTATTTTGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006208
ATGCCATCATCCAACAATTCTTCAAATCATTTTTCCACCAATTCTTCATCTGACGAAGAAGTTCCAAACCCACAATTTTCTACTCTTCCCGATCCTATGCAAAATCCCGAAGGATTTTTTATGAGTCTTGCTGCAAATTTCATGCAAGTGGCGAGTTCATATCAATTCGATCCTCCTCATCTACCGATGAAGAAGCGTAAAGTTATTCTCCGTGATCGTGAAGGTGGTGGTGAGCGCCTTCATCGGGATTATTTTGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789374.1
MPSSNNSSNHFSTNSSSDEEVPNPQFSTLPDPMQNPEGFFMSLAANFMQVASSYQFDPPHLPMKKRKVILRDREGGGERLHRDYFVDDAVYGPQSFQRHFRMSRALFLRIVNALEVDPYFQQHPDACGHLASHQSKSAQRRFGETTTLACLNKFCKAVVRIFSGVYLRRPTTADVQRLATMHEVKHSFPRMLGSLDCMHWAWKNCPVVWHGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFFGVAGSNSDINFLNQSTLFND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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