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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005967`

染色体: Chr01 坐标: 75373607-75376565 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005967`
名称	SmilChr01G005967
描述	uncharacterized RNA-binding protein C1827.05c
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75373607 - 75376565 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006234`
GeneID	`131006234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006234`
原始查询	`LOC131006234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0412200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0412200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G04600` (AT5G04600) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830337] identity=62.9; qcov=0.869; evalue=2.04e-86; confidence=high
Rice	`Os08g0412200` - identity=56.9; qcov=1.02; evalue=3.14e-88; confidence=high
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789392.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057789392.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.40000	`XP_057789392.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789392.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789392.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75373902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B31,B48
`Chr1:75373949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B110,B60,B66
`Chr1:75374086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:75374516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,B82
`Chr1:75374547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:75375823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B110,B60,B66
`Chr1:75375979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:75376019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:75376034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:75376045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:75376072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B129,B27,B7
`Chr1:75376073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789392.1

257 aa

128

257

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-122 aa

XP_057789393.1

214 aa

107

214

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789392.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	122	2.2e-13	50.6	RNA recognition motif
`XP_057789393.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	122	1.8e-13	50.8	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933410.1
TTGGACTAATGTGTAGATATAAAATAGTATAGGGGGCAAGATGCAACTCATTCGCTTTTAGGAGAAACCCTGTCGCAAGTAGGGTTTTAACCTCCCTTCTCTTCTTCTTCTTCGAATTCCGTCGACTGCAAAAAATGGGATTGAAAGCGAAGAAGAAGTCAGCTTCGAAGAGTTCGAAGAAGGCCGCCGCTCAGTTTTCTTCTGCTTCAAAAGCCGAAGGCGCTGATTTCTTGCCGTTGGCGGGTGGTCCGGCGAGGGGT...

XM_057933409.1
TTGGACTAATGTGTAGATATAAAATAGTATAGGGGGCAAGATGCAACTCATTCGCTTTTAGGAGAAACCCTGTCGCAAGTAGGGTTTTAACCTCCCTTCTCTTCTTCTTCTTCGAATTCCGTCGACTGCAAAAAATGGGATTGAAAGCGAAGAAGAAGTCAGCTTCGAAGAGTTCGAAGAAGGCCGCCGCTCAGTTTTCTTCTGCTTCAAAAGCCGAAGGCGCTGATTTCTTGCCGTTGGCGGGTGGTCCGGCGAGGGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006234
ATGGGATTGAAAGCGAAGAAGAAGTCAGCTTCGAAGAGTTCGAAGAAGGCCGCCGCTCAGTTTTCTTCTGCTTCAAAAGCCGAAGGCGCTGATTTCTTGCCGTTGGCGGGTGGTCCGGCGAGGGGTATTCCGAAGACTGAGAGTAGTGAGAACAAATCAACTGTGTTGTATATTGGGCGAATCCCTCATGGGTTCTATGAGACTGAGATGGAAGCTTTCTTTAAGCAGTTTGGTGCGGTTAAGAGACTCAGGATCGCTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789392.1
MGLKAKKKSASKSSKKAAAQFSSASKAEGADFLPLAGGPARGIPKTESSENKSTVLYIGRIPHGFYETEMEAFFKQFGAVKRLRIARNKKTGKSKHFGFIEFVSPEVAKVVEECMHNYLMYEHLLQVSLVPPEKVHPRLWKGVGRSYKPLNWVQIERKHHDKERTLEQQQKLVAGVLKRDQKRRKRIEAAGIYYECPEIVRHYVASLNFADIRLMVDSFRVVHDRCKRSILVSLMILSCHLQVGCVQPTPKKIRFAD

XP_057789393.1
MGLKAKKKSASKSSKKAAAQFSSASKAEGADFLPLAGGPARGIPKTESSENKSTVLYIGRIPHGFYETEMEAFFKQFGAVKRLRIARNKKTGKSKHFGFIEFVSPEVAKVVEECMHNYLMYEHLLQVSLVPPEKVHPRLWKGVGRSYKPLNWVQIERKHHDKERTLEQQQKLVAGVLKRDQKRRKRIEAAGIYYECPEIVGCVQPTPKKIRFAD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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