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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001696`

染色体: Chr01 坐标: 31228976-31230418 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001696`
名称	SmilChr01G001696
描述	uncharacterized SmilChr01G001696
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31228976 - 31230418 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006252`
GeneID	`131006252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006252`
原始查询	`LOC131006252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332]; symbol=AT2G06541; hit=AT2G06541; species=arabidopsis; confidence=low
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332]; symbol=AT2G06541; hit=AT2G06541; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G06541` (AT2G06541) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240332] identity=33.3; qcov=1.17; evalue=8e-48; confidence=low
Rice	`Os02g0301400` - identity=37.4; qcov=0.462; evalue=7.49e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789420.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789420.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789420.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789420.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31228994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr1:31228994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:31229054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:31229079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:31229081`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B123,B125,B35,B85,B87,C41,D3
`Chr1:31229148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:31229210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D4
`Chr1:31229210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:31229244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:31229815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B83
`Chr1:31229815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:31229834`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B54,B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789420.1

301 aa

150

301

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 2-100 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 6-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789420.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	2	100	5.3e-37	128.4	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057789420.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	6	104	1.2e-12	48.6	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933437.1
ATGGCCAATAGAGTACGCCAAATGATTCATGAAGAAGTTGGAGATAAATATTTTTGTATTCTTGTTGACGAAGCACAAGATATCTCCAAGAAAGAGAAAATGGCCATTATCTTGAGGTTTGTGAATGATCAGAGAATTTTGACTGAACATTTTTTTGCAATTAAAAGCGTTAGTGACACTACTTCACTAAATTTGAAGAAAGAGATATGTCGTGTTATTTCTCATCATGATTTGCAGGTTGAGAAAATGAGAGGTCATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006252
ATGGCCAATAGAGTACGCCAAATGATTCATGAAGAAGTTGGAGATAAATATTTTTGTATTCTTGTTGACGAAGCACAAGATATCTCCAAGAAAGAGAAAATGGCCATTATCTTGAGGTTTGTGAATGATCAGAGAATTTTGACTGAACATTTTTTTGCAATTAAAAGCGTTAGTGACACTACTTCACTAAATTTGAAGAAAGAGATATGTCGTGTTATTTCTCATCATGATTTGCAGGTTGAGAAAATGAGAGGTCATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789420.1
MANRVRQMIHEEVGDKYFCILVDEAQDISKKEKMAIILRFVNDQRILTEHFFAIKSVSDTTSLNLKKEICRVISHHDLQVEKMRGHGYDGASNMRGSWNGLQTLFLRDCPYAYYIHCFAHRLQLAIVSAAKDISVIWEFISHLDNVVNIITSSPKRILQRKVQDILAAIAFVSTTKTILQELRESGCWEEFLEEVKVFCLKNDIDVPNLDSLYKILKTLSNQFNSDNICKLARKFYPEDFTDQDIVSLEYELEHYKHDVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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