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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006006`

染色体: Chr01 坐标: 75623935-75627006 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006006`
名称	SmilChr01G006006
描述	receptor-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75623935 - 75627006 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006255`
GeneID	`131006255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006255`
原始查询	`LOC131006255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 7
产物	receptor-like protein 7
Arabidopsis	`AT3G25020` (RLP42) receptor like protein 42 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822093] identity=35.3; qcov=1.02; evalue=1.38e-120; confidence=medium
Rice	`Os01g0163000` - identity=34.8; qcov=1.12; evalue=1.22e-133; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789419.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789419.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789419.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789419.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75624116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B20,B59,C72
`Chr1:75624219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:75624224`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	53	A1,A13,A14,A16,A9,B10,B103,B109,B113,B114,B119,B125,B127,B135,B139,B15,B24,B25,B29,B31,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B48,B51,B53,B55,B56,B79,B90,B92,B93,B96,C1,C14,C16,C21,C23,C26,C31,C42,C45,C50,C56,C61,C64,C66,C7,C76,C80
`Chr1:75624228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:75624236`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A1,A13,A14,A16,A9,B10,B103,B109,B113,B114,B119,B125,B127,B135,B139,B15,B24,B25,B29,B31,B38,B42,B43,B44,B45,B48,B51,B53,B55,B56,B79,B90,B92,B93,B96,C1,C14,C16,C21,C23,C26,C31,C42,C45,C50,C56,C61,C64,C66,C7,C76,C80
`Chr1:75624293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B118
`Chr1:75624364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C85
`Chr1:75624423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C67,C86,D4
`Chr1:75624440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr1:75624447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:75624514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D2
`Chr1:75624524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789419.1

871 aa

436

871

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_6

LRR_1

LRR_4

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 23-64 aa PF13855 LRR_8 250-310 aa PF00560 LRR_1 251-273 aa PF00560 LRR_1 300-321 aa PF00560 LRR_1 401-419 aa PF00560 LRR_1 469-490 aa PF00560 LRR_1 493-512 aa PF00560 LRR_1 540-561 aa PF00560 LRR_1 693-715 aa PF13855 LRR_8 710-752 aa PF13516 LRR_6 715-729 aa PF00560 LRR_1 717-739 aa PF12799 LRR_4 717-756 aa PF00560 LRR_1 742-758 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	23	64	7e-08	33.3	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	250	310	3e-39	133.3	Leucine rich repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	251	273	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	300	321	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	401	419	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	469	490	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	493	512	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	540	561	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	693	715	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	710	752	3e-39	133.3	Leucine rich repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	715	729	2.3e-09	37.3	Leucine Rich repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	717	739	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	717	756	2.2e-37	126.9	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057789419.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	742	758	3.2e-47	149.0	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933436.1
GGCAATTTCTTCAATTCTCCACTTTTTTGATTACTAGCATGAAAAAGCGTTACCAAGATTGGCCTACTTGTGGAATATATATATAAGGTGGGAGACAACGACTTTGAAATCGCAATGCAAAACAGTGCAGATTTAAACCGACAAACACTTCTTCGCTTCCACACTTGTTTTTCTTCTTCGCTTCCTAATGGGTCTTTCAAGTGGTCGTCTCTTAATAAGAAATCGAGTGCTTATTTAAAGCCACATTCACGTACCTTAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006255
ATGCTTTCGAAGTTGTTTTTCATTTCTATACTTTCCTCCTTCATTTTCATTACTCATTCTTGTCTTGACCATCAGAAAAAGTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAATTGAGCTTCGACTCTTCTTTCTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATGAAACGGATGAGTGCTGCAAGTGGCACGGTGTGGAATGTGATGCAGCTGGCTACGTCGTTAGTTTGCAGCTCGATCATGAGTCCATTTCTGGTGAAATCGCGGATTCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789419.1
MLSKLFFISILSSFIFITHSCLDHQKKLLLQLKDELSFDSSFSTKLVRWNETDECCKWHGVECDAAGYVVSLQLDHESISGEIADSSSLFRLVHLQKLNLAYNKFNNTRIPKGIHNLTYLTHLNLSNAEFGGQVPLQLSFLRRLVCLDISYEYLGTLSLEYPNLEMLVSNLTGLRELYLDRVGVTSSHERRKWSHIISSYLPNLTTLSLVRCGLSGPLAKSFWQLHSLSILRLDWNNLGPELPDLFTNFPSLTTLSLSDC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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