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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006009`

染色体: Chr01 坐标: 75647259-75650179 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006009`
名称	SmilChr01G006009
描述	laccase-14-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75647259 - 75650179 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006260`
GeneID	`131006260`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006260`
原始查询	`LOC131006260`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-14-like
产物	laccase-14-like
Arabidopsis	`AT5G09360` (LAC14) laccase 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830795] identity=46.5; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0749700` (OsLAC10) - identity=46.9; qcov=1.01; evalue=5.85e-180; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006260

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057789425.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789425.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789425.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789425.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789425.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75647407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C7
`Chr1:75647411`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	67	A11,A14,A24,A4,B100,B103,B105,B110,B112,B124,B13,B135,B139,B14,B17,B2,B29,B31,B32,B42,B43,B45,B46,B5,B50,B6,B70,B75,B76,B78,B8,B80,B81,B85,B9,B93,C2,C20,C21,C23,C3,C35,C37,C39,C4,C41,C43,C45,C46,C47,C49,C50,C52,C55,C56,C6,C60,C65,C72,C73,C75,C78,C81,C83,C85,C9,D2
`Chr1:75647469`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	169	A1,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A8,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B129,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B19,B2,B21,B22,B23,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B37,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B6,B60,B62,B67,B68,B69,B70,B71,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C12,C14,C16,C17,C18,C21,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D6,D8
`Chr1:75647472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:75647475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:75647702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr1:75647785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B59,D7,D9
`Chr1:75647846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B122,B41,B67
`Chr1:75647900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr1:75647929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,D11
`Chr1:75648107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:75648119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789425.1

578 aa

289

578

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 32-146 aa PF00394 Cu-oxidase 159-288 aa PF07731 Cu-oxidase_2 413-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789425.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	32	146	3.3e-40	137.6	Multicopper oxidase
`XP_057789425.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	159	288	1.4e-35	123.5	Multicopper oxidase
`XP_057789425.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	413	549	7.5e-43	146.3	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933442.1
AATAAATGCACACCACTGAAAAAAATGTTTTGTTATAGGAAGCTCAAGGTTTTCATGCTGTGCTACCTTGGTATTATTATGGCTCCAGTCCATGCTGTAGTTCATCATAAGTTTGAAGTGAGAAGATCTTCACACACAAGGCTATGCACCACCAAAAGCATGCTAACGGTAAACGGGCAGTTCCCAGGGCCAACTATATATGCTAGAAGGGGAGAATTGGTGGTAGTCGATGTTATTAATCGTGCCGATGCAAATATTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006260
ATGTTTTGTTATAGGAAGCTCAAGGTTTTCATGCTGTGCTACCTTGGTATTATTATGGCTCCAGTCCATGCTGTAGTTCATCATAAGTTTGAAGTGAGAAGATCTTCACACACAAGGCTATGCACCACCAAAAGCATGCTAACGGTAAACGGGCAGTTCCCAGGGCCAACTATATATGCTAGAAGGGGAGAATTGGTGGTAGTCGATGTTATTAATCGTGCCGATGCAAATATTACTATCCATTGGCATGGAGTAAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789425.1
MFCYRKLKVFMLCYLGIIMAPVHAVVHHKFEVRRSSHTRLCTTKSMLTVNGQFPGPTIYARRGELVVVDVINRADANITIHWHGVKMPRYPWTDGVDSVTQCPITPGKSFRQRVLLSDEEGTLFWHAHIDWTRATVYGAIVILPPKTHTYPFPKPHAQLPILLGEWWNDDMQQVYEDFIAQGIGAKLSDAFLMNGQPGDLYPCSKQDTLKLSVEPGKTYLIRMVNAMMNFIMYFKIKDHNVTVVGMDGAYTKPLNTDHIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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