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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006023`

染色体: Chr01 坐标: 75809484-75811839 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006023`
名称	SmilChr01G006023
描述	uncharacterized SmilChr01G006023
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75809484 - 75811839 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006279`
GeneID	`131006279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006279`
原始查询	`LOC131006279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RAP release 2, galactose-binding-like domain protein, putative (DUF1997) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830323]; symbol=AT5G04440; hit=AT5G04440; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RAP release 2, galactose-binding-like domain protein, putative (DUF1997) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830323]; symbol=AT5G04440; hit=AT5G04440; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G04440` (AT5G04440) RAP release 2, galactose-binding-like domain protein, putative (DUF1997) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830323] identity=80.4; qcov=0.816; evalue=3.34e-118; confidence=high
Rice	`Os03g0146500` - identity=77.4; qcov=0.779; evalue=1.28e-110; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09366 (DUF1997)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789454.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057789454.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057789454.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057789454.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75811399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:75811400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:75811424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C34,C53
`Chr1:75811545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B74,C21,C74,C9,D11
`Chr1:75811572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C48
`Chr1:75811617`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A7,B140,B4,B42,B43,B66,B67,C53,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789454.1

244 aa

122

244

DUF1997

PF09366 DUF1997 74-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789454.1`	Pfam	`PF09366`	DUF1997	Family	74	230	2.7e-44	151.7	Protein of unknown function (DUF1997)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933471.1
AGAACATCTTTTTCGAACCTCAAATCTAGGGATTGAAAATCTCAATTAGCGCATTTTAGTCTCATACGTCCAGATCCCATCTAACCTGCGCCCGTACGTCCCATTCTGCACTTTTGTAACCCTCGTGGACTTATCCTACACCACACCCTGCTATCCATTCACACTCCCAAAGCTCACTCACAAACAGCAAGCACTTCCCATTCCCCAATTTCTGCAAAAAAATGGCATCGCTAACCCCAAATCCAATCCAATTCCAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006279
ATGGCATCGCTAACCCCAAATCCAATCCAATTCCAGTTCAGAAACCCTAAAGCCCCATTCCGGAGATCCAACCCTCCATACGTCGTCGTATTCTCCAACCTCGCCTCCTCGCCGGACGATTCCTCCAAACCCGCGCTTCGCATTTCCGCCGATTCCGCCCCCAAAGCCCGATTTATCGCGCGAAGAACTGAATCCGTCTTCGTGCGTCAGCTCCAGCGCCCGCTCACTGAGTACATGAGCTTGCCGGCGAGTCAGTACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789454.1
MASLTPNPIQFQFRNPKAPFRRSNPPYVVVFSNLASSPDDSSKPALRISADSAPKARFIARRTESVFVRQLQRPLTEYMSLPASQYSVLDAERIERVDDNTFRCYVYRFKFFAFEVCPVLLVRVEEQPNGCCINLLSCKLEGSPIVVAQNDKFDASMENKISCDSPRSDSPVQKLTSDAVIEVSIDIPFAFRAIPTQSIESTGSQVLGQILKAMLPRFMSQLVKDYQAWASGDTSRQPLGTGEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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