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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006031`

染色体: Chr01 坐标: 75850588-75853136 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006031`
名称	SmilChr01G006031
描述	putative FBD-associated F-box protein At5g56690
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75850588 - 75853136 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006287`
GeneID	`131006287`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006287`
原始查询	`LOC131006287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative FBD-associated F-box protein At5g56690
产物	putative FBD-associated F-box protein At5g56690
Arabidopsis	`AT3G28410` (AT3G28410) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822470] identity=29.4; qcov=0.47; evalue=2.8e-15; confidence=low
Rice	`Os06g0161300` (OsFbox297) - identity=27.1; qcov=0.907; evalue=9.9e-20; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006287

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789466.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789466.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789466.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789466.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75850880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:75850887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:75850889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr1:75850930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B68
`Chr1:75850947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B41,B85,C58
`Chr1:75851057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:75851101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr1:75851133`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B136,B35,B41,B85,C58
`Chr1:75851133`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B136,B35,B41,B85,C58
`Chr1:75851577`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A10,A3,B134,B32,B45,B6,B71,B89,B94,B97,C58,C67,C78,D10,D3
`Chr1:75851583`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A10,A3,B134,B45,B6,B71,B89,B94,B97,C58,C67,C78,D10,D3
`Chr1:75851590`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A10,A3,B134,B45,B6,B71,B89,B94,B97,C58,C67,C78,D10,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789466.1

485 aa

242

485

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 21-56 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 107-437 aa PF24758 LRR_At5g56370 114-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789466.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	21	56	1.9e-06	28.3	F-box domain
`XP_057789466.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	107	437	3.9e-17	63.4	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057789466.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	114	228	1.4e-11	45.2	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933483.1
GTTCCATAGTTTAAGCAGAAGAATTCATCTTGTGATTTAGGAAGAGTAAATTTATCGTCTTTTCCGATGGCAAAATCCAGAAAACGAAAGCTGGTGGGAATAGATGATGCTGTCAATAATGGTGGTATTGATAGATTGCCTGATGATTTAGTAATTAACATTCTATCACACATGAGCATGAAGAGAGCTGTGAGGACTAGTGTCCTCGCACATAGATGGAGATATCTTTGGAGTTTTTCCCATGAGATTCTGCGATTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006287
ATGGCAAAATCCAGAAAACGAAAGCTGGTGGGAATAGATGATGCTGTCAATAATGGTGGTATTGATAGATTGCCTGATGATTTAGTAATTAACATTCTATCACACATGAGCATGAAGAGAGCTGTGAGGACTAGTGTCCTCGCACATAGATGGAGATATCTTTGGAGTTTTTCCCATGAGATTCTGCGATTTGATGGAAAACTAATGGAAAAGGAAAAATTCGAGTCTTGGGTGAATGGTGTGCTGGATCATCTTCATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789466.1
MAKSRKRKLVGIDDAVNNGGIDRLPDDLVINILSHMSMKRAVRTSVLAHRWRYLWSFSHEILRFDGKLMEKEKFESWVNGVLDHLHQGRYIEGMIISFEGGVGMDETASTSRAVEKWLNFAMQKEVQRLELNLSFEDIYRYKCPGFRYAFPTLDELRSHSPSRSRAFCRLRSLRLAHVQISHDVVHYFLASCPDLEELCIRLSYYIQGDLRVVDPPSLRVLEITRCPYIASLEISAVSLVSLKYGGAKNSLLLKKAPNLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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