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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006046`

染色体: Chr01 坐标: 75964762-75967661 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006046`
名称	SmilChr01G006046
描述	receptor-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75964762 - 75967661 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006300`
GeneID	`131006300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006300`
原始查询	`LOC131006300`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 7
产物	receptor-like protein 7
Arabidopsis	`AT3G11010` (RLP34) receptor like protein 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820272] identity=33.8; qcov=1.07; evalue=7.49e-125; confidence=low
Rice	`Os01g0163000` - identity=35.9; qcov=1.09; evalue=6.06e-147; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789477.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789477.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789477.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789477.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789477.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75964781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B59,C50
`Chr1:75964853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C23
`Chr1:75964915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B59,C20,C50,C7
`Chr1:75964915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,C20,C50,C7
`Chr1:75964916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:75964980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B126,C27,C62,D11
`Chr1:75964992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:75965015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C32,D1
`Chr1:75965018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,C17,C25,C61,C8
`Chr1:75965025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B112,C39,C79,C8
`Chr1:75965056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C39,C79,D11
`Chr1:75965155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789477.1

892 aa

446

892

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_6

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 24-64 aa PF00560 LRR_1 94-117 aa PF00560 LRR_1 246-268 aa PF13855 LRR_8 309-355 aa PF00560 LRR_1 320-341 aa PF00560 LRR_1 420-438 aa PF00560 LRR_1 489-508 aa PF00560 LRR_1 513-531 aa PF00560 LRR_1 560-581 aa PF00560 LRR_1 687-706 aa PF13855 LRR_8 688-743 aa PF00560 LRR_1 708-730 aa PF13855 LRR_8 708-767 aa PF13516 LRR_6 730-745 aa PF00560 LRR_1 732-754 aa PF00560 LRR_1 757-773 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	24	64	2.1e-08	35.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	94	117	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	246	268	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	309	355	1.5e-42	143.9	Leucine rich repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	320	341	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	420	438	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	489	508	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	513	531	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	560	581	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	687	706	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	688	743	1.5e-42	143.9	Leucine rich repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	708	730	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	708	767	1.5e-42	143.9	Leucine rich repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	730	745	2e-07	31.2	Leucine Rich repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	732	754	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789477.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	757	773	3e-46	146.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933494.1
GTCCTCTTCACAATGCTTCCAAAGTTGTTTTTCATTTCTATACTTTTCTCCTTCATTTTTATTACTCATTCATGTCTTCACTATCAAAAAACCGTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAGCTTCGATTCTTATATTTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATGAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGCCCGGTGTGGAATGTGATGCTGCTGGCTACGTCGTTAGTTTGCAGCTCGATCATGAGTCCATTTCTGGTGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006300
ATGCTTCCAAAGTTGTTTTTCATTTCTATACTTTTCTCCTTCATTTTTATTACTCATTCATGTCTTCACTATCAAAAAACCGTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAGCTTCGATTCTTATATTTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATGAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGCCCGGTGTGGAATGTGATGCTGCTGGCTACGTCGTTAGTTTGCAGCTCGATCATGAGTCCATTTCTGGTGGAATCGCGGATTCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789477.1
MLPKLFFISILFSFIFITHSCLHYQKTVLLQLKDELSFDSYISTKLVRWNESDECCKWPGVECDAAGYVVSLQLDHESISGGIADSSSLFRLVHLQKLNLAYNHFNNTPIPRGIQNLTYLTHLNLSYAYFGGQVPAEISSLRRLVSLDISNGYVSVELEILVQNLIGLRELYLDGSNVTSSDHERRKWSHIISSYLPNLTALSMNLCGLSGPLAKSFGQLHSLSILRLDENDLETELPDLFANFPSLTTLSLSSCGLKGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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