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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006096`

染色体: Chr01 坐标: 76429314-76437730 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006096`
名称	SmilChr01G006096
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76429314 - 76437730 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006326`
GeneID	`131006326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006326`
原始查询	`LOC131006326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT1G71400` (RLP12) receptor like protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843481] identity=39.1; qcov=0.993; evalue=4.6e-107; confidence=medium
Rice	`Os12g0211500` - identity=37.9; qcov=0.974; evalue=8.72e-93; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789519.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789519.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789519.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789519.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76429827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B84
`Chr1:76429842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:76429902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C11,C60,C69
`Chr1:76431983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B82,B98,C10,C37
`Chr1:76432004`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr1:76432004`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr1:76435347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:76435350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr1:76435405`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A5
`Chr1:76435405`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A5
`Chr1:76435408`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A5
`Chr1:76435408`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789519.1

536 aa

268

536

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF13855 LRR_8 19-78 aa PF00560 LRR_1 43-65 aa PF00560 LRR_1 67-89 aa PF00560 LRR_1 91-113 aa PF00560 LRR_1 115-137 aa PF00560 LRR_1 139-161 aa PF00560 LRR_1 188-210 aa PF13855 LRR_8 189-247 aa PF00560 LRR_1 263-280 aa PF00560 LRR_1 333-353 aa PF00560 LRR_1 355-376 aa PF00560 LRR_1 380-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	19	78	2.3e-31	108.1	Leucine rich repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	43	65	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	67	89	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	91	113	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	115	137	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	139	161	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	188	210	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	189	247	2.3e-31	108.1	Leucine rich repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	263	280	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	333	353	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	355	376	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789519.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	380	401	1.6e-40	129.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933536.1
GTATGGATATTTTTATTTTCATTATTTGAATTTTTTTAGTCCCACCCTTGTAATGGGATATTAGCTCACGTAATAGTATTTATGAAGGTCTTGAGATATCCTAAAATCTTACTTATGTTATTTTTATTTATCTAAGATAATCGTAAACAATAATTATCAACACACCTTTTGTTTATATCCACAACTTCCCCCATTGACGTTCACATTTTATTTCTTCGAGTTTATTTCTCTTCGCCGACCGTCACCAAATTTTCTTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006326
ATGAGTTCCAACAATCTTAGTGGACCATTTCCAAGACAAATTTTGAACATCACAAGTCTCCGTTACCTATTCCTTCATGGCGCCTCTTTAAATGGTCCAATACCATCCACCATTGGGAATCTATCCAATTTGCGGTTGCTATGGCTCTCTTCCAACAAATTAAATGGTCCAATACCATCCACCATTGGGAATCTATCAAATTTGTGGTGGCTAGACCTCTCTGACAACAAATTAAGCGGTCCAATACCATCCACCATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789519.1
MSSNNLSGPFPRQILNITSLRYLFLHGASLNGPIPSTIGNLSNLRLLWLSSNKLNGPIPSTIGNLSNLWWLDLSDNKLSGPIPSTIGNLSNLLSLYLSSNKLNGPIPSTIGNLSNLVSLELSSNKLNGELPFSICNLTSLQFLLLSNNSLEGTIPQCFRNLNKSLSIFHLNANNFSGPIPSIFINGCSLWSINLSGNKLQGRLPKSLINCKSLKGLDVGNNRIQDEFPFWMEALPKLRVLILKSNKFDGNMSLPARSNLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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