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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000247`

染色体: Chr01 坐标: 4649148-4650305 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000247`
名称	SmilChr01G000247
描述	uncharacterized SmilChr01G000247
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	4649148 - 4650305 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006359`
GeneID	`131006359`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006359`
原始查询	`LOC131006359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=25.8; qcov=0.242; evalue=4.28e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006359

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789550.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789550.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057789550.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789550.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789550.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:4649155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:4649167`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C11,C35,C69
`Chr1:4649167`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C11,C35,C69
`Chr1:4649170`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A11,A18,A2,A21,A24,A9,B103,B104,B106,B107,B110,B119,B137,B139,B16,B19,B21,B25,B27,B3,B31,B56,B61,B65,B68,B71,B88,B96,C24,C3,C37,C42,C45,C48,C62,C80,D5
`Chr1:4649171`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A2,A21,B104,B109,B113,B124,B17,B53,B55,B60,C15,C26,C71,D4,D9
`Chr1:4649194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr1:4649231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:4649255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C18,C38
`Chr1:4649265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C76
`Chr1:4649283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B4,C31,C83
`Chr1:4649291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:4649318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C38,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789550.1

385 aa

192

385

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 198-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789550.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	198	288	3.4e-06	28.4	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933567.1
ATGGAATCCCAGTCGGCTACAATCAAGCATCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAACCAGATGCAACAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTCCATGGACAAGGATTGCAGCCCCACCAAGCTCAAGCTGTCACTGTTTTACGCAGTGGGAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCCGTGGAAGAACCACCCAAGGAAGCCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCAGCCAAGAGAGGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006359
ATGGAATCCCAGTCGGCTACAATCAAGCATCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAACCAGATGCAACAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTCCATGGACAAGGATTGCAGCCCCACCAAGCTCAAGCTGTCACTGTTTTACGCAGTGGGAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCCGTGGAAGAACCACCCAAGGAAGCCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCAGCCAAGAGAGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789550.1
MESQSATIKHLETTVGQLSGTLNQMQQQQQPGKLHGQGLQPHQAQAVTVLRSGKVVNNKVEAPVEEPPKEARMEEQVKEPLQPREEEKEPEVKLHKAAKPYKPPVPYPSRLKNETLDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIRNVPAYLKFFKELASKKRRFEDNEKILVSEVANSIMQQPLSTKQRDPGSFVINIALGNGKEASGMLDLGVGINLMPYSIFKQLELGNLKPTRMCLQLADRSVRYPHGVVEDILVRVGGLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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