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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001735`

染色体: Chr01 坐标: 31952861-31954060 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001735`
名称	SmilChr01G001735
描述	uncharacterized SmilChr01G001735
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31952861 - 31954060 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006386`
GeneID	`131006386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006386`
原始查询	`LOC131006386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789543.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789543.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789543.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789543.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789543.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31952906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B120,B45,B64,C49,C69,C75,C76
`Chr1:31952912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B56,B98,C36
`Chr1:31952920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,C35,C5,C66,C7
`Chr1:31952926`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A4,B12,B40,B78,B84,C53,D3
`Chr1:31952931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B42,C15,C18,C70
`Chr1:31952938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C74,C81
`Chr1:31952947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B7
`Chr1:31952961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A18,A3
`Chr1:31952976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B7,C45
`Chr1:31952984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C23
`Chr1:31952995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:31952996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C12,C47,C71,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789543.1

365 aa

182

365

DUF1985

DUF8566

PF09331 DUF1985 12-146 aa PF29561 DUF8566 20-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789543.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	12	146	1.4e-12	48.5	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057789543.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	20	167	2.3e-07	31.5	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933560.1
TTCACTGATTGGAGACCTAGCATGAACAGCAATAGAGCATTGCACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGAAGACGATGAGATGTGCTTCTTTCTGTGCGGAGCACGAGTCAGATTTTCCCCCACGGACTACGCATTAGTGACTGGGCTCAATTTCGGTCCAACGATGTTCGATGCGACATTACAGCACGACTGCAGTCGCGTGGAGGCATACCGACGATTCTGCGGTGGGCGAACCATGACCATACAGGCGCTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006386
ATGAACAGCAATAGAGCATTGCACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGAAGACGATGAGATGTGCTTCTTTCTGTGCGGAGCACGAGTCAGATTTTCCCCCACGGACTACGCATTAGTGACTGGGCTCAATTTCGGTCCAACGATGTTCGATGCGACATTACAGCACGACTGCAGTCGCGTGGAGGCATACCGACGATTCTGCGGTGGGCGAACCATGACCATACAGGCGCTCATTAAACGTGTGTGCAATTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789543.1
MNSNRALHQIVSRQIVSEDDEMCFFLCGARVRFSPTDYALVTGLNFGPTMFDATLQHDCSRVEAYRRFCGGRTMTIQALIKRVCNLDRRVDDEDGSLYLRVVLVCVAHTIVLGLDTRVQPWLWVLVDDLDAFDRFPWGAYSYKMLCHYTTEIGTGEKYHFYGPSWALYVWALERVPGFRQMVAASSGDATAHPRCLRWNFRGKPRLHGLRDLFEGQGGVLGLDPDEHDLASNYFISALTPGELSVSFKSPDNPLARGVQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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