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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001737`

染色体: Chr01 坐标: 31973353-31975064 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001737`
名称	SmilChr01G001737
描述	uncharacterized SmilChr01G001737
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31973353 - 31975064 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006397`
GeneID	`131006397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006397`
原始查询	`LOC131006397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789551.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057789551.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057789551.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789551.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789551.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31973360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B89,B90,C80
`Chr1:31973370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B89,B90,C80
`Chr1:31973397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:31973399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr1:31973443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:31973470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:31973478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A9,B125
`Chr1:31973478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B125
`Chr1:31973493`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	81	A1,A10,A14,A15,A18,A20,A23,A25,A4,A5,A6,B100,B110,B118,B126,B128,B129,B131,B135,B136,B138,B139,B140,B19,B25,B33,B4,B40,B41,B44,B47,B49,B52,B59,B69,B7,B72,B75,B77,B79,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B94,B98,B99,C12,C14,C18,C19,C21,C25,C29,C33,C34,C36,C39,C40,C42,C43,C46,C48,C56,C60,C61,C64,C68,C71,C75,C77,C8,C80,C83,C85,D10,D5,D6,D8
`Chr1:31973508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B119
`Chr1:31973635`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A14,A15,B13,B35,B40,B92,B98,C17,C38,C86
`Chr1:31973668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789551.1

378 aa

189

378

DUF7769

PF24964 DUF7769 5-59 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789551.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	5	59	3.9e-06	27.1	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933568.1
ATGAGAAAAGATCTAACAACAACACAAAGAAATCAAGTGGTGCAATTCATCCTTCAAGGCAGCATCAATGGAAAGGCGCAATATGGCAGATTAGAGGAAGCTCGGCAGAAATTCTGTACCTCTCGTTCCACTATTGCTCGGCTGTGGAGGTCTGCAAAACAGCAACATGAAGAAGGCGAAGTTATCAACAGTGTAAGTCGAAAGATTACTACAAAGCGTAGAACTAAAGTTCACCTAGATTTGAGTATTCTTTCAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006397
ATGAGAAAAGATCTAACAACAACACAAAGAAATCAAGTGGTGCAATTCATCCTTCAAGGCAGCATCAATGGAAAGGCGCAATATGGCAGATTAGAGGAAGCTCGGCAGAAATTCTGTACCTCTCGTTCCACTATTGCTCGGCTGTGGAGGTCTGCAAAACAGCAACATGAAGAAGGCGAAGTTATCAACAGTGTAAGTCGAAAGATTACTACAAAGCGTAGAACTAAAGTTCACCTAGATTTGAGTATTCTTTCAAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789551.1
MRKDLTTTQRNQVVQFILQGSINGKAQYGRLEEARQKFCTSRSTIARLWRSAKQQHEEGEVINSVSRKITTKRRTKVHLDLSILSNLEYTKRGTIRRLAVGLEISRSTIGFLKKIKFRDMHNTVHIDEKWFYITRGSHRPLIADDGTVLFDGKIGIFPFTIQVPAKRNSRNRQAGTLETKAIESITNEVIKDCLINKIIPAIMAKWPEGASKDIFIQQDNARPHILDSDPDFRKAASQRGFNIRLTQQPPNSPDCNVNDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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