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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006170`

染色体: Chr01 坐标: 77205882-77208954 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006170`
名称	SmilChr01G006170
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77205882 - 77208954 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006399`
GeneID	`131006399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006399`
原始查询	`LOC131006399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.8; qcov=0.811; evalue=2.22e-84; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=28.1; qcov=0.923; evalue=2.75e-82; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0004803 (transposase activity); GO:0006313 (DNA transposition); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789547.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789547.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789547.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789547.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77206033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B35
`Chr1:77206058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B96,B97,C34,C67
`Chr1:77206064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:77206066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:77206077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A1,A11,A5,A8,A9,B10,B100,B103,B104,B108,B112,B113,B125,B129,B132,B140,B17,B19,B2,B26,B36,B4,B42,B43,B69,B71,B72,B82,B85,B9,B92,B97,B98,C11,C12,C13,C14,C17,C18,C20,C30,C35,C36,C37,C38,C4,C45,C46,C5,C56,C58,C59,C63,C65,C69,C71,C73,C74,C75,C76,C82,C85,C87,D5,D9
`Chr1:77206115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C38
`Chr1:77206130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C58
`Chr1:77206132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B53,B69,B77,C63
`Chr1:77206154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B69
`Chr1:77206164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C24,C42
`Chr1:77206212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:77206228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A24,B84,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789547.1

737 aa

368

737

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 47-141 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 234-343 aa PF10551 MULE 263-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789547.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	47	141	3.3e-15	57.3	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057789547.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	234	343	4.6e-11	43.5	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057789547.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	263	354	5.2e-27	94.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933564.1
TCTAGCTTTGACGTTTTGTTTTTGTTGCAGCAAGTTGGTATATCATCGTCGGCGTCCTTCATCTGAAGTCTCCATCGGCGTCCTTCATCTGAAGTCTCCATCATTCCGGCGAACTATAAAATTACTTATAAAATCGGCAGCGCAAACATCATCGTCCGTTGAACCTGCGATGGAGTTTGGCTCGTGTAGTACAGGTGACTCAACGACAAATGAAGTTGAAGGTTGTGCCGATCTTTTTATCCCTTACTGTGATGCTAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006399
ATGGAGTTTGGCTCGTGTAGTACAGGTGACTCAACGACAAATGAAGTTGAAGGTTGTGCCGATCTTTTTATCCCTTACTGTGATGCTAAGGAAAAACCATTTGAGGGGCAGATTTTCTGTAATCTTCAAGAAGCTGAGAAGTTTTATGAGGATTACGCAAAAGTATGTGGTTTTATTCCTCGCAAGGCTACCATCAACAGAGATGACGATGGGTCCATAAGTACTCGATTTATGCTTTGTAATAGAGAAGGTGCTCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789547.1
MEFGSCSTGDSTTNEVEGCADLFIPYCDAKEKPFEGQIFCNLQEAEKFYEDYAKVCGFIPRKATINRDDDGSISTRFMLCNREGAPNHADSLILVEGNREDKKRKRTSFKIGCRARIIFKAMSYDRFRVGTFSEGHNHKMVTESSRHFMSSNRQVDEVHQFFIHAGIKANIGPTKTFRIFKEIVGGYDKVGCTSIDFKNYGRDLKVYVAGSDAHMLLETFKDRKELCDGFQYFYDVDEEKQLRRLIWTDKQAVINFKNFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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