当前解析结果
SmilChr01G006176| 统一新 Gene ID | SmilChr01G006176 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G006176 |
| 描述 | adenine/guanine permease AZG1 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 77283353 - 77287497 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006404 |
|---|---|
| GeneID | 131006404 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006404 |
| 原始查询 | LOC131006404 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | adenine/guanine permease AZG1 |
| 产物 | adenine/guanine permease AZG1 |
| Arabidopsis | AT3G10960 (AZG1)AZA-guanine resistant1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820267] identity=76.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os05g0332600- identity=76.3; qcov=0.66; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005345 (purine nucleobase transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0055085 (transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00860 (Xan_ur_permease) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006404 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057789558.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789558.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789558.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789558.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789558.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:77283521 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B23,B77 |
Chr1:77285727 |
AGC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C8 |
Chr1:77285727 |
AGC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr1:77285881 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:77286127 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr1:77286136 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B138,B47,B55,C4 |
Chr1:77286160 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:77286274 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:77286365 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C21 |
Chr1:77286533 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,C84 |
Chr1:77286631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr1:77286781 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789558.1PF00860
Xan_ur_permease 115-230 aa
PF00860
Xan_ur_permease 294-518 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789558.1 |
Pfam | PF00860 |
Xan_ur_permease | Family | 115 | 230 | 9.8e-27 | 94.4 | Permease family |
XP_057789558.1 |
Pfam | PF00860 |
Xan_ur_permease | Family | 294 | 518 | 9.8e-27 | 94.4 | Permease family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。