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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006179`

染色体: Chr01 坐标: 77323374-77328995 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006179`
名称	SmilChr01G006179
描述	5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77323374 - 77328995 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006406`
GeneID	`131006406`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006406`
原始查询	`LOC131006406`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase, chloroplastic
产物	5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G10970` (AT3G10970) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820268] identity=76.2; qcov=0.869; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0168300` - identity=70.8; qcov=0.831; evalue=2.7e-167; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00702 (Hydrolase); PF13419 (HAD_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006406

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789560.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057789560.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057789560.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789560.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789560.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77328013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:77328078`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C50
`Chr1:77328078`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C50
`Chr1:77328080`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C50
`Chr1:77328080`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789560.1

367 aa

184

367

Hydrolase

HAD_2

PF00702 Hydrolase 134-298 aa PF13419 HAD_2 134-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789560.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	134	298	2.3e-09	38.7	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057789560.1`	Pfam	`PF13419`	HAD_2	Family	134	305	3.4e-16	60.5	Haloacid dehalogenase-like hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933577.1
AAATAAATCATAAATAAAATAGCAGGTATAACAAGTTCCAGAGGTAGGCCGCCCTTCCAAAAATGGAGAATGCTCTCAGCTGCACCTCTTGTTCTCTGCTACCTGTCACTCCCGCCTCCCCTCTCTCTCTTACCCCCTCGTCTAAACTCACATTTTTGAGATTAAATCGCGCAAGCGCCGCGGAAGAGCAGCAGCGCCGGAGTAAATCTTTAGTGATTAGGAATGGTTTTGGCTCGGATGAGAATGGACAGCTTAACGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006406
ATGGAGAATGCTCTCAGCTGCACCTCTTGTTCTCTGCTACCTGTCACTCCCGCCTCCCCTCTCTCTCTTACCCCCTCGTCTAAACTCACATTTTTGAGATTAAATCGCGCAAGCGCCGCGGAAGAGCAGCAGCGCCGGAGTAAATCTTTAGTGATTAGGAATGGTTTTGGCTCGGATGAGAATGGACAGCTTAACGGGTTCCCGAATATACCCAACAAGATTTTCATGGAGGAGGTCATTGGAGCAGAATATGGCGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789560.1
MENALSCTSCSLLPVTPASPLSLTPSSKLTFLRLNRASAAEEQQRRSKSLVIRNGFGSDENGQLNGFPNIPNKIFMEEVIGAEYGEGFETFRPEGPLKVDVDFLNDRMQEGFLQRIRYAMKPDEAYGLIFSWDVVADTQALKLRAWEQLASEEGKEIPNDDNVQRFLLYAGADHVLRKVLLWEKDEDDVDRLKSRLSQLYYDNLIKFSEPVEGLKEWLDALSTSRIPCAVVSSLDRKNMVDTLQRMGLKNYFQAVVSEED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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