当前解析结果
SmilChr01G006196| 统一新 Gene ID | SmilChr01G006196 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G006196 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G006196 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 77615967 - 77617944 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006418 |
|---|---|
| GeneID | 131006418 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006418 |
| 原始查询 | LOC131006418 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | potassium transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824796]; symbol=AT3G56290; hit=AT3G56290; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | potassium transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824796]; symbol=AT3G56290; hit=AT3G56290; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G56290 (AT3G56290)potassium transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824796] identity=83.2; qcov=0.688; evalue=1.13e-68; confidence=high |
| Rice | Os01g0823600- identity=80.2; qcov=0.699; evalue=2.1e-67; confidence=high |
| GO | GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006418 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057789572.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057789572.1 |
| 3 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057789572.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057789572.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789572.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:77616091 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr1:77617592 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B22,B88 |
Chr1:77617742 |
CAT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 53 | A11,A13,A18,A24,B113,B117,B122,B125,B126,B127,B134,B136,B140,B19,B22,B24,B33,B47,B48,B49,B5,B59,B61,B69,B73,B75,B76,B80,B82,B93,B94,B98,C13,C16,C17,C19,C2,C29,C31,C32,C42,C46,C49,C50,C56,C68,C71,C73,C77,C79,C83,D11,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。