当前解析结果
SmilChr01G000014| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000014 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000014 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000014 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 295734 - 296318 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006432 |
|---|---|
| GeneID | 131006432 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006432 |
| 原始查询 | LOC131006432 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0142900- identity=24.2; qcov=1; evalue=6.69e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006432 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057789584.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057789584.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789584.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789584.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789584.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789584.1PF08284
RVP_2 5-108 aa
PF13650
Asp_protease_2 7-90 aa
PF13975
gag-asp_proteas 8-92 aa
PF30863
PRO_PEG10-RTL1 12-108 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789584.1 |
Pfam | PF08284 |
RVP_2 | Domain | 5 | 108 | 1.7e-25 | 90.1 | Retroviral aspartyl protease |
XP_057789584.1 |
Pfam | PF13650 |
Asp_protease_2 | Domain | 7 | 90 | 2.4e-06 | 28.9 | Aspartyl protease |
XP_057789584.1 |
Pfam | PF13975 |
gag-asp_proteas | Domain | 8 | 92 | 6.9e-07 | 30.5 | gag-polyprotein putative aspartyl protease |
XP_057789584.1 |
Pfam | PF30863 |
PRO_PEG10-RTL1 | Domain | 12 | 108 | 2.3e-08 | 35.2 | PEG10/RTL1 protease domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。