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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000373`

染色体: Chr01 坐标: 7686227-7698295 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000373`
名称	SmilChr01G000373
描述	SAC3 family protein C
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	7686227 - 7698295 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006465`
GeneID	`131006465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006465`
原始查询	`LOC131006465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SAC3 family protein C
产物	SAC3 family protein C
Arabidopsis	`AT3G54380` (SAC3C) SAC3/GANP/Nin1/mts3/eIF-3 p25 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824604] identity=53.4; qcov=0.845; evalue=1.31e-123; confidence=high
Rice	`Os03g0352200` - identity=68.8; qcov=0.116; evalue=2.22e-16; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006406 (mRNA export from nucleus); GO:0070390 (transcription export complex 2)
KEGG	-
Pfam	PF03399 (SAC3_GANP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789605.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789606.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057789605.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057789605.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:7686517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:7686529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:7687801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:7687820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:7689755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C8
`Chr1:7692154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789605.1

420 aa

210

420

SAC3_GANP

PF03399 SAC3_GANP 86-375 aa

XP_057789606.1

414 aa

207

414

SAC3_GANP

PF03399 SAC3_GANP 86-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789605.1`	Pfam	`PF03399`	SAC3_GANP	Family	86	375	1.5e-75	255.0	SAC3/GANP family
`XP_057789606.1`	Pfam	`PF03399`	SAC3_GANP	Family	86	375	1.4e-75	255.1	SAC3/GANP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933622.1
TCACCCATGAGGTTGCCCTCATCCAAGACCAATAAAGCTAATTGACTCAACTTGACTTGTTAAAGATTGCAGTTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCTCAAGGTTACCTCCGAATTGTTAATAAAAGAAGAAAAAAGAAGAAGAAGAGCTCAAGGTCTTCAACCATGGCGGACAGACGTCGTCAGCCCTACAAACCTAGAAGAAACGATTCTTCTTCATCCTATTCGTCACACTCCGATTCCATCCAATCCAATATTCCAA...

XM_057933623.1
GTTAAAGATTGCAGTTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCTCAAGGTTACCTCCGAATTGTTAATAAAAGAAGAAAAAAGAAGAAGAAGAGCTCAAGGTCTTCAACCATGGCGGACAGACGTCGTCAGCCCTACAAACCTAGAAGAAACGATTCTTCTTCATCCTATTCGTCACACTCCGATTCCATCCAATCCAATATTCCAAAAGCTTCTAATCAAATTCCCAACAGCTCCAGGATCAGCCCCTCCTATAAAAGCACCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006465
ATGGCGGACAGACGTCGTCAGCCCTACAAACCTAGAAGAAACGATTCTTCTTCATCCTATTCGTCACACTCCGATTCCATCCAATCCAATATTCCAAAAGCTTCTAATCAAATTCCCAACAGCTCCAGGATCAGCCCCTCCTATAAAAGCACCACCTCCAGTTCGAAAACTGATGATTTTAGCAACAGGCTTGACAGTAATCATTATGGTGATGACGATCGAGATCCCCCAAACCTAATCGGGGCTTGCCCTTTCATGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789605.1
MADRRRQPYKPRRNDSSSSYSSHSDSIQSNIPKASNQIPNSSRISPSYKSTTSSSKTDDFSNRLDSNHYGDDDRDPPNLIGACPFMCPVEERERRERLRDLAVFERLHGNPAKTSPTLAVKKFCRTISSKDIKASDVRPVPVLEDTLNYLLDLLCSSGRPFDVVHDFIFDRTRSIRQDLSMQNIVTDQVICMYERMVKFHIISYHHLHRSSRTPNTASMFHLNLEQLMKVMTTLFSLYDVNRAAHSMSPNESEFFSLYLL...

XP_057789606.1
MADRRRQPYKPRRNDSSSSYSSHSDSIQSNIPKASNQIPNSSRISPSYKSTTSSSKTDDFSNRLDSNHYGDDDRDPPNLIGACPFMCPVEERERRERLRDLAVFERLHGNPAKTSPTLAVKKFCRTISSKDIKASDVRPVPVLEDTLNYLLDLLCSSGRPFDVVHDFIFDRTRSIRQDLSMQNIVTDQVICMYERMVKFHIISYHHLHRSSRTPNTASMFHLNLEQLMKVMTTLFSLYDVNRAAHSMSPNESEFFSLYLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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