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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000410`

染色体: Chr01 坐标: 8341498-8344945 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000410`
名称	SmilChr01G000410
描述	60S ribosomal protein L5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8341498 - 8344945 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006492`
GeneID	`131006492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006492`
原始查询	`LOC131006492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L5-like
产物	60S ribosomal protein L5-like
Arabidopsis	`AT3G25520` (ATL5) ribosomal protein L5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822138] identity=80.8; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0896700` (RPL5B) - identity=79.3; qcov=0.954; evalue=1.25e-177; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0008097 (5S rRNA binding); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF14204 (Ribosomal_L18_c); PF17144 (Ribosomal_L5e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789626.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057789626.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057789626.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789626.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789626.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8342042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D1
`Chr1:8342162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B21,D1
`Chr1:8342171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D9
`Chr1:8342339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D11
`Chr1:8342340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B126,B9,B94,C44
`Chr1:8342411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B139,B98
`Chr1:8342610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr1:8342654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:8342655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:8342674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B75,C71
`Chr1:8343033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B135,B49,C31,C8
`Chr1:8343372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789626.1

304 aa

152

304

Ribosomal_L5e

Ribosomal_L18_c

PF17144 Ribosomal_L5e 14-175 aa PF14204 Ribosomal_L18_c 235-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789626.1`	Pfam	`PF17144`	Ribosomal_L5e	Family	14	175	2.5e-80	269.0	Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
`XP_057789626.1`	Pfam	`PF14204`	Ribosomal_L18_c	Domain	235	289	8.3e-20	72.0	Ribosomal L18 C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933643.1
GAATTTCTCACCATTTTCTTCCCTTCTTCTCCTCTTCAGTAAAAACACAATAAATACATCCTTGCTGCTTGCGCATTTTTCGACCTCCTTCCCCGTCGTTCCAAGTTTGCCGGTTAACTTCCCTTCAACAGTAGGTATCTATTCTGCTCTACTCACTTGATTTCTCCTTCTTAGTGTAATGGCGCCCAAAGAAATTGATTGACCGTAAGAACCTTCTCCCTTCCCTTCGACCATTCACTCCAACAATCTCAATCTAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006492
ATGGTTTTTGTCAAAGCCCAAAAATCGAAAGCTTACTTCAAGCGTTTCCAAGTTAAGTACAAGAGAAGAAGAGAGGGAAAGACTGACTATCGGGCAAGGATTCGCATGATCAATCAGGATAAGAACAAGTACAACACGCCAAAGTTTCGCTATGTTGTGCGATTTACCAATAAGGATATAATTTGCCAAATTTTGTCATCTAGCATCGCTGGTGATCACGTCCTTGCTGCTGCGTATGCGCATGAGCTGCCTCATTATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789626.1
MVFVKAQKSKAYFKRFQVKYKRRREGKTDYRARIRMINQDKNKYNTPKFRYVVRFTNKDIICQILSSSIAGDHVLAAAYAHELPHYGLEVGLTNYAAAYCTGLLLSRRVLKTLELDEEYEGNVEATGEDYSVEPAESRRPFRALLDVGLIKTTTGNRVFGALKGALDGGLDIPHSDKRFAGFSKDSKQLDAEVHRKYIYGGHVASYMRTLIEDEPEKYQSHFSEYIKRGIEADNIEEVYKKVHAAIRADPTPKKSEKKQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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