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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000421`

染色体: Chr01 坐标: 8470537-8474719 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000421`
名称	SmilChr01G000421
描述	uncharacterized SmilChr01G000421
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8470537 - 8474719 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006501`
GeneID	`131006501`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006501`
原始查询	`LOC131006501`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RPA-interacting protein A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826888]; symbol=AT4G12760; hit=AT4G12760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RPA-interacting protein A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826888]; symbol=AT4G12760; hit=AT4G12760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G12760` (AT4G12760) RPA-interacting protein A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826888] identity=52; qcov=0.954; evalue=1.54e-83; confidence=high
Rice	`Os05g0417300` - identity=39.7; qcov=0.969; evalue=3.21e-60; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006606 (protein import into nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF14766 (RPA_interact_N); PF14767 (RPA_interact_M); PF14768 (RPA_interact_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006501

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789635.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789635.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789635.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057789635.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8470923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:8470926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,C9
`Chr1:8471975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:8473816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D9
`Chr1:8474327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C1,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789635.1

260 aa

130

260

RPA_interact_N

RPA_interact_M

RPA_interact_C

PF14766 RPA_interact_N 24-55 aa PF14767 RPA_interact_M 72-161 aa PF14768 RPA_interact_C 177-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789635.1`	Pfam	`PF14766`	RPA_interact_N	Family	24	55	1.6e-11	44.4	Replication protein A interacting N-terminal
`XP_057789635.1`	Pfam	`PF14767`	RPA_interact_M	Family	72	161	2.4e-22	80.0	Replication protein A interacting middle
`XP_057789635.1`	Pfam	`PF14768`	RPA_interact_C	Family	177	257	8.6e-20	71.8	Replication protein A interacting C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933652.1
AAAGAATTTCAAAAGGTTGAATTTCGTGCTCTTGAATTAATTTAATTTACTTTATTTTCCCTAACTTTATTTGTTCGGAGTAATTCAATTTGCGGTTGAATTTGATAGGGAATTTAGGGTATCGGAGGCAGAGTCTCTTACTGAACGTGAAGATAAGAAAATGGCGGGAGATGATGCAGAGAAAGAGCTACGAAATCATCGCCCTTCTTTGAAAACCCCTCCTTCCCTCAATAATTACCCAAACTGGAAAACCAAGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006501
ATGGCGGGAGATGATGCAGAGAAAGAGCTACGAAATCATCGCCCTTCTTTGAAAACCCCTCCTTCCCTCAATAATTACCCAAACTGGAAAACCAAGCTCCGGGAGAATTGCTTCCGAAGGGTTCGCGAGGATCGAACTCGGTTGCTCTGGAAATTGAGACTACCCGATCTTAAGAGCCAATCTTCCAACAACAAGGATCTCATCAATTCAAGCCTTCAGGGCATAGTTTCTGATGAACTAAGAAAAATTAAGGGATTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789635.1
MAGDDAEKELRNHRPSLKTPPSLNNYPNWKTKLRENCFRRVREDRTRLLWKLRLPDLKSQSSNNKDLINSSLQGIVSDELRKIKGFSLDESSAPTCRNATDDMIWEYDGLQTAYAGDCEEILLEMQNIFYEELGRGESRKEPEKLITTWDDEEDEYLARIVFDHMQLNSDQVSPEVWCPICKQGKLQENGHNIYCNRCKFELKRDHEVDLNFLRLRLGEAHTEHLVKGCRLKPEFCVETKFQLTAIYIKCQGCDTFDIVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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