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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000443`

染色体: Chr01 坐标: 8995181-9000011 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000443`
名称	SmilChr01G000443
描述	uncharacterized SmilChr01G000443
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8995181 - 9000011 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006513`
GeneID	`131006513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006513`
原始查询	`LOC131006513`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Class I peptide chain release factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840227]; symbol=AT1G33330; hit=AT1G33330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Class I peptide chain release factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840227]; symbol=AT1G33330; hit=AT1G33330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G33330` (AT1G33330) Class I peptide chain release factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840227] identity=68.6; qcov=0.68; evalue=2.95e-76; confidence=high
Rice	`Os01g0887400` - identity=71.8; qcov=0.672; evalue=3.46e-76; confidence=high
GO	GO:0003747 (translation release factor activity); GO:0006415 (translational termination); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00472 (RF-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057789643.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057789643.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789646.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789646.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789646.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8997328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:8997530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C87
`Chr1:8997655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,D7
`Chr1:8998387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:8998405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:8998423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789643.1

267 aa

134

267

RF-1

PF00472 RF-1 106-165 aa

XP_057789644.1

267 aa

134

267

RF-1

PF00472 RF-1 106-165 aa

XP_057789645.1

267 aa

134

267

RF-1

PF00472 RF-1 106-165 aa

XP_057789646.1

253 aa

126

253

RF-1

PF00472 RF-1 106-169 aa

XP_057789647.1

253 aa

126

253

RF-1

PF00472 RF-1 106-169 aa

XP_057789648.1

253 aa

126

253

RF-1

PF00472 RF-1 106-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789643.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	106	165	4.1e-19	69.4	RF-1 domain
`XP_057789644.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	106	165	4.1e-19	69.4	RF-1 domain
`XP_057789645.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	106	165	4.1e-19	69.4	RF-1 domain
`XP_057789646.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	106	169	1.8e-19	70.5	RF-1 domain
`XP_057789647.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	106	169	1.8e-19	70.5	RF-1 domain
`XP_057789648.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	106	169	1.8e-19	70.5	RF-1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933662.1
TATGAATTGAGTTTATTCAGTATGAAAGCCAAATATCTATATTTATACAAGTAAAATGTTAGGATTTTAGGGTAAATTTAGAAGATATATTTGCGACATTTTCACCTATTAACAAAATTTGTAAATTGGTCTCATATCCGAATCCGAATGCTAACCAACGGGGCAGCTGCTCTCAGATAACTCAATAACTTGACGCCGTTCCCGTCCTCCAACCTCCGCCGCAGCCACCCTCGCCTTATCCATGAACTAACAGTGGTGAA...

XM_057933663.1
TTTAGGGTAAATTTAGAAGATATATTTGCGACATTTTCACCTATTAACAAAATTTGTAAATTGGTCTCATATCCGAATCCGAATGCTAACCAACGGGGCAGCTGCTCTCAGATAACTCAATAACTTGACGCCGTTCCCGTCCTCCAACCTCCGCCGCAGCCACCCTCGCCTTATCCATGAACTAACAGTGGTGAATCATGCGTGCTGTTAAAGTACTGCTTGGCAGTTTTGCTCATGCCTGTTGAACGATTGCACTTAAG...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131006513
ATGGCCCATTCTATTCTGAGATCATTTTTCAGATTCCCAAGCGGTGGCATCTCAAAGCCTGCCTATGCCTACTCTTGGTGGCATGGATATAGCAGCCATCAGGGTTATGGCAGAATTTGCTTTGATCGGAAAGCTAATAATAGTAGGCTTTTGAATGGAGTAACAAGTTTCCATTTTGTTAAAGAAGCTAGTATTATAGGGTTTCCAAATGGAGTTATTGCAGCATGCTCTAGAAACTACAATTCAAGTATTACTAGTAC...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057789643.1
MAHSILRSFFRFPSGGISKPAYAYSWWHGYSSHQGYGRICFDRKANNSRLLNGVTSFHFVKEASIIGFPNGVIAACSRNYNSSITSTCETVDGSEYLAMTDEKLMSQCEMGTFKVSGPGGQHRNKRESAVRLKHLPTGIIAQASEDRSQHKNRAVALSRLRKLLALKVRNTIDLETYVPPPELVQILPTKSTIRLDKGSQIGPNNPKFALGMQALIDLIFAAGGSVSDAAKKLGLSTGALSRLILSDDSLRHAVNEFRVD...

XP_057789644.1
MAHSILRSFFRFPSGGISKPAYAYSWWHGYSSHQGYGRICFDRKANNSRLLNGVTSFHFVKEASIIGFPNGVIAACSRNYNSSITSTCETVDGSEYLAMTDEKLMSQCEMGTFKVSGPGGQHRNKRESAVRLKHLPTGIIAQASEDRSQHKNRAVALSRLRKLLALKVRNTIDLETYVPPPELVQILPTKSTIRLDKGSQIGPNNPKFALGMQALIDLIFAAGGSVSDAAKKLGLSTGALSRLILSDDSLRHAVNEFRVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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