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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000442`

染色体: Chr01 坐标: 8993465-8995763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000442`
名称	SmilChr01G000442
描述	CBS domain-containing protein CBSX3, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8993465 - 8995763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006515`
GeneID	`131006515`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006515`
原始查询	`LOC131006515`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBS domain-containing protein CBSX3, mitochondrial-like
产物	CBS domain-containing protein CBSX3%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G10860` (CBSX3) Cystathionine beta-synthase (CBS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830953] identity=77.5; qcov=1.02; evalue=9.04e-114; confidence=high
Rice	`Os03g0737000` (OsCBSX4) - identity=71.8; qcov=1.02; evalue=1.45e-106; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006515

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057789649.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057789649.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789649.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789649.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8994370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:8994422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B90,B92,D10
`Chr1:8994442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:8994448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:8995133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:8995136`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr1:8995136`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr1:8995139`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr1:8995139`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr1:8995338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789649.1

204 aa

102

204

CBS

PF00571 CBS 70-118 aa PF00571 CBS 130-186 aa

XP_057789650.1

204 aa

102

204

CBS

PF00571 CBS 70-118 aa PF00571 CBS 130-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789649.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	70	118	1.6e-23	83.5	CBS domain
`XP_057789649.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	130	186	1.6e-23	83.5	CBS domain
`XP_057789650.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	70	118	1.6e-23	83.5	CBS domain
`XP_057789650.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	130	186	1.6e-23	83.5	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933666.1
TAATTTATAAGCTTTGTGTATGTATATGTAATAAAGTTGGACAGCACAAGTAGTGAAGTTGTGGGGCGGATTTAAATTGAAAAAGATCCATTTTCATCTGCTCCTTCATTCTCTCCTCTCATTTTGCTGCAACGTTTCTCACTTCTGTCTGAATTGCAGGCACAATGCAAGGAGGAATTAAAGGTATTTTGTCACACAGCAATGTGATAAAGAGTGCAGTTGTGAGGCACCTACGCGTGGCGCCTCCAGTGATGTTTGCA...

XM_057933667.1
TGTATATGTAATAAAGTTGGACAGCACAAGTAGTGAAGTTGTGGGGCGGATTTAAATTGAAAAAGATCCATTTTCATCTGCTCCTTCATTCTCTCCTCTCATTTTGCTGCAACGTTTCTCACTTCTGGCACAATGCAAGGAGGAATTAAAGGTATTTTGTCACACAGCAATGTGATAAAGAGTGCAGTTGTGAGGCACCTACGCGTGGCGCCTCCAGTGATGTTTGCACGGCATGAATCCACGACGCCTGCTGCTCGTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006515
ATGCAAGGAGGAATTAAAGGTATTTTGTCACACAGCAATGTGATAAAGAGTGCAGTTGTGAGGCACCTACGCGTGGCGCCTCCAGTGATGTTTGCACGGCATGAATCCACGACGCCTGCTGCTCGTATGGAGGAGCATGGCTTCGAGAGCGCCACCATTTCCGATGTTCTGTCAGCAAAAGGGAAAACTGCGGATGGATCTTGGCTGTGGTGCACCATGGAAGATACCGTGTACGATGCTGTCAAGTCGATGACTCAACA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789649.1
MQGGIKGILSHSNVIKSAVVRHLRVAPPVMFARHESTTPAARMEEHGFESATISDVLSAKGKTADGSWLWCTMEDTVYDAVKSMTQHNVGALVVVKPAAGEHKSIAGIITERDYLRKIIVQGRSSKSTKVGDIMTEENKLITVTPDTKVLKAMQLMTDNRIRHIPVISEGGMIGMVSIGDVVRAVVSEHREELDRLNAFIQGGY

XP_057789650.1
MQGGIKGILSHSNVIKSAVVRHLRVAPPVMFARHESTTPAARMEEHGFESATISDVLSAKGKTADGSWLWCTMEDTVYDAVKSMTQHNVGALVVVKPAAGEHKSIAGIITERDYLRKIIVQGRSSKSTKVGDIMTEENKLITVTPDTKVLKAMQLMTDNRIRHIPVISEGGMIGMVSIGDVVRAVVSEHREELDRLNAFIQGGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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