当前解析结果
SmilChr01G000475| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000475 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000475 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000475 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 9702437 - 9703472 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006540 |
|---|---|
| GeneID | 131006540 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006540 |
| 原始查询 | LOC131006540 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0555300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os01g0555300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G11280 (AT5G11280)tail fiber [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830998] identity=38.1; qcov=1.05; evalue=4.81e-33; confidence=medium |
| Rice | Os01g0555300- identity=34.1; qcov=1.05; evalue=2.93e-34; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006540 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.80000 | XP_057789676.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057789676.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.60000 | XP_057789676.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.40000 | XP_057789676.1 |
| 5 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.20000 | XP_057789676.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:9702873 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr1:9703182 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B47,B53,B63,C61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。