当前解析结果
SmilChr01G001777| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001777 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001777 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001777 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 32663814 - 32665195 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006550 |
|---|---|
| GeneID | 131006550 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006550 |
| 原始查询 | LOC131006550 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G66235 (AT1G66235)no-apical-meristem-associated carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842939] identity=27.5; qcov=0.728; evalue=2.6e-10; confidence=low |
| Rice | Os06g0521000- identity=31.1; qcov=0.733; evalue=1.46e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006550 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789679.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789679.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789679.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789679.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057789679.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:32663846 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B11,C15,C33 |
Chr1:32663869 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:32663878 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B54 |
Chr1:32663892 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,B25,C9 |
Chr1:32663907 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B41,B72,B90,C32,C68 |
Chr1:32663918 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C45 |
Chr1:32663918 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C45 |
Chr1:32663933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B108,B37,B43,C34,D3 |
Chr1:32663933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B108,B37,B43,C34,D3 |
Chr1:32663968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,B57,B68,C34 |
Chr1:32663977 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B80 |
Chr1:32663988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。