当前解析结果
SmilChr01G000493| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000493 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000493 |
| 描述 | cytochrome b-c1 complex subunit 8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 10046263 - 10047132 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006554 |
|---|---|
| GeneID | 131006554 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006554 |
| 原始查询 | LOC131006554 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome b-c1 complex subunit 8-like |
| 产物 | cytochrome b-c1 complex subunit 8-like |
| Arabidopsis | AT5G05370 (AT5G05370)Cytochrome b-c1 complex, subunit 8 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830419] identity=68.1; qcov=1; evalue=7.22e-34; confidence=medium |
| Rice | Os06g0175900- identity=70.8; qcov=1; evalue=9.38e-35; confidence=medium |
| GO | GO:0005750 (GO:0005750); GO:0006122 (mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c); GO:0070469 (GO:0070469) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF10890 (Cyt_b-c1_8) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006554 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057789680.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057789680.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057789680.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789680.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789680.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:10046825 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,C60 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789680.1PF10890
Cyt_b-c1_8 1-72 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789680.1 |
Pfam | PF10890 |
Cyt_b-c1_8 | Family | 1 | 72 | 7.3e-35 | 119.9 | Cytochrome b-c1 complex subunit 8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。