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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000496`

染色体: Chr01 坐标: 10102018-10105606 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000496`
名称	SmilChr01G000496
描述	putative B3 domain-containing protein At5g58280
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	10102018 - 10105606 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006555`
GeneID	`131006555`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006555`
原始查询	`LOC131006555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative B3 domain-containing protein At5g58280
产物	putative B3 domain-containing protein At5g58280
Arabidopsis	`AT5G58280` (AT5G58280) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835940] identity=50.6; qcov=0.904; evalue=2.3e-78; confidence=high
Rice	`Os05g0481400` - identity=45.3; qcov=0.946; evalue=7.43e-68; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006555

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789681.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789681.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789681.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789681.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789681.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:10102332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C60
`Chr1:10103163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789681.1

285 aa

142

285

PF02362 B3 145-235 aa

XP_057789682.1

280 aa

140

280

PF02362 B3 140-230 aa

XP_057789683.1

280 aa

140

280

PF02362 B3 140-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789681.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	145	235	3.6e-17	62.9	B3 DNA binding domain
`XP_057789682.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	140	230	3.5e-17	62.9	B3 DNA binding domain
`XP_057789683.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	140	230	3.5e-17	62.9	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933699.1
TTTAAAGCAGAGGAGAGCGCGAGAAGGCCTTTTCAAATTTCATTCTCTTTCCTCATTTTCAAAAAGTTTTTTTTCCCTCTTCGTCTCTCTCTTTCTCCCTCCGCGCATAGCATTTATCCAAATTTGGATAAGCTGAGATTTCAAGAGCCGGTACTTTCCTGATGGTTTTGGCAACGATGGAAAATGAAAGTGGCAACACTTATGAAGATGCTCGAAAGCAGAGGCTGTTAGAAAATAAAAAAAGATTTGAGGATTTGGGG...

XM_057933698.1
GTTAAATGATTTTCATTTTGACTATATTCTTGATGCAACGTTTTCTTTCCGCTTTACTGGCATTTTTGTACTAAATCCTCTGCGTGAATCTCTCTATTTATGTTATTTGAAATTCAATCTCAAAACCGATATCTCTTATGAGCCGATCATGATCTTCATATAAATACGGCATCTATATATGTGTCTTCATAATCATATTATTGTGTTTCGAGATGTTTTCAATTCGTTTCCTTCCAAAATGTCCTGGTTTTATTGTTTCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006555
ATGGGTACTTTCCTGATGGTTTTGGCAACGATGGAAAATGAAAGTGGCAACACTTATGAAGATGCTCGAAAGCAGAGGCTGTTAGAAAATAAAAAAAGATTTGAGGATTTGGGGATAATGAAGTTATCTAAAAGCCTAACAGATGTAACCAAGTCAGAGAAACCCCAGAACAGGCAAGTTCGCCTAAAACCAATGATGAGTTACTCAGCAGAACCAAGACGTTCATCACGTGCTCGAAATCAAGTTTCATATCGTGATGA...

LOC131006555
ATGGTTTTGGCAACGATGGAAAATGAAAGTGGCAACACTTATGAAGATGCTCGAAAGCAGAGGCTGTTAGAAAATAAAAAAAGATTTGAGGATTTGGGGATAATGAAGTTATCTAAAAGCCTAACAGATGTAACCAAGTCAGAGAAACCCCAGAACAGGCAAGTTCGCCTAAAACCAATGATGAGTTACTCAGCAGAACCAAGACGTTCATCACGTGCTCGAAATCAAGTTTCATATCGTGATGATGTTGATGTCGAGCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057789681.1
MGTFLMVLATMENESGNTYEDARKQRLLENKKRFEDLGIMKLSKSLTDVTKSEKPQNRQVRLKPMMSYSAEPRRSSRARNQVSYRDDVDVELPALRNRSKFNSSWTSYLARPAEEVKVASYEERARAFNCAEKLRSNLQTRNPSFIKSMVRSHVYSCFWLGLPSRFCEDYLPKSTVGMVLENEQGSEYEALFIGKRAGLSGGWRAFALDHKLDDGDALIFELIEPTRFKVYIVRTSGCQNENGCVVASDTDEKPKKKRKT...

XP_057789682.1
MVLATMENESGNTYEDARKQRLLENKKRFEDLGIMKLSKSLTDVTKSEKPQNRQVRLKPMMSYSAEPRRSSRARNQVSYRDDVDVELPALRNRSKFNSSWTSYLARPAEEVKVASYEERARAFNCAEKLRSNLQTRNPSFIKSMVRSHVYSCFWLGLPSRFCEDYLPKSTVGMVLENEQGSEYEALFIGKRAGLSGGWRAFALDHKLDDGDALIFELIEPTRFKVYIVRTSGCQNENGCVVASDTDEKPKKKRKTKDGNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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