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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000509`

染色体: Chr01 坐标: 10339985-10346317 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000509`
名称	SmilChr01G000509
描述	KH domain-containing protein At2g38610-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	10339985 - 10346317 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006568`
GeneID	`131006568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006568`
原始查询	`LOC131006568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KH domain-containing protein At2g38610-like
产物	KH domain-containing protein At2g38610-like
Arabidopsis	`AT2G38610` (AT2G38610) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818443] identity=67.8; qcov=1.01; evalue=3.12e-131; confidence=high
Rice	`Os07g0227400` - identity=64.7; qcov=0.983; evalue=3.28e-126; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0048024 (regulation of mRNA splicing, via spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF16544 (STAR_dimer); PF22675 (KH-I_KHDC4-BBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789689.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057789689.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057789689.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057789691.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057789689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:10340490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:10340491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B94
`Chr1:10341718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B75,B9,C44
`Chr1:10341894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B19,C56,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789689.1

343 aa

172

343

STAR_dimer

KH-I_KHDC4-BBP

PF16544 STAR_dimer 78-127 aa PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 204-294 aa

XP_057789690.1

342 aa

171

342

STAR_dimer

KH-I_KHDC4-BBP

PF16544 STAR_dimer 78-127 aa PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 203-293 aa

XP_057789691.1

291 aa

146

291

STAR_dimer

KH-I_KHDC4-BBP

PF16544 STAR_dimer 26-75 aa PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 152-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789689.1`	Pfam	`PF16544`	STAR_dimer	Domain	78	127	3.5e-15	56.0	Homodimerisation region of STAR domain protein
`XP_057789689.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	204	294	3.3e-21	75.6	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I
`XP_057789690.1`	Pfam	`PF16544`	STAR_dimer	Domain	78	127	3.5e-15	56.0	Homodimerisation region of STAR domain protein
`XP_057789690.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	203	293	3.4e-21	75.6	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I
`XP_057789691.1`	Pfam	`PF16544`	STAR_dimer	Domain	26	75	2.6e-15	56.4	Homodimerisation region of STAR domain protein
`XP_057789691.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	152	242	2.3e-21	76.1	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933708.1
GTATTTATACTTAAAATTTACCACGACCACGAGGATAGTGATGACATAGTCCCCCGACAAATGCATTGAAAGCCTTAACCTACACAATCTTGCGGCAGAAACCTCCCCTCCACCATCTCTCTTCTCCGCCCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTGCAGTAAAAACTCAGGAGAAACGAATCCATCTCTCTCTATCTCTGTTGTTTTTAATTATTTGATTTTTTATTTACTGTCTCGAATTCACACAGACAAAACTCCAGC...

XM_057933707.1
TAGTGATGACATAGTCCCCCGACAAATGCATTGAAAGCCTTAACCTACACAATCTTGCGGCAGAAACCTCCCCTCCACCATCTCTCTTCTCCGCCCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTGCAGTAAAAACTCAGGAGAAACGAATCCATCTCTCTCTATCTCTGTTGTTTTTAATTATTTGATTTTTTATTTACTGTCTCGAATTCACACAGACAAAACTCCAGCCAAGAAACGTGTGTATTATATACCCCACAACTATT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006568
ATGCCTACAAGTCGACACAGCCCAGAAAAAGGGTTTTTCGTATCACAGTGCACCCACGCACACACACATTCATTTTCTTGCCTAGCCTTTGAGCCACCACCCAAAATTCTCTCACTCCACCAATCCCCCTACTCGTGTGTATATGCGGATACAGCCATGTCTAGTTTGTACCCTCAGAATTTGAACTTCTCCCCGGCCAGGAACATCCCTTCTCCACATCTGAGGCCCAACCCCGATGCCGAGGGCCAATATTTGACGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057789689.1
MPTSRHSPEKGFFVSQCTHAHTHSFSCLAFEPPPKILSLHQSPYSCVYADTAMSSLYPQNLNFSPARNIPSPHLRPNPDAEGQYLTEMLAERQKLGPFMQVLPICSRLLDQEILRVSGRMSNHGFNDYDRLQRGSPNPVPSLEVMPDVGGKGLGSWNGNGWNSMQHEQRLGGPQGMTIDWKPPGSPSSFLVKRVLRLDIPVDRYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTGCRVFIRGKGSIKDADKEESLRGKPGYEHLNE...

XP_057789690.1
MPTSRHSPEKGFFVSQCTHAHTHSFSCLAFEPPPKILSLHQSPYSCVYADTAMSSLYPQNLNFSPARNIPSPHLRPNPDAEGQYLTEMLAERQKLGPFMQVLPICSRLLDQEILRVSGRMSNHGFNDYDRLQRGSPNPVPSLEVMPDVGGKGLGSWNGNGWNSMQHERLGGPQGMTIDWKPPGSPSSFLVKRVLRLDIPVDRYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTGCRVFIRGKGSIKDADKEESLRGKPGYEHLNEP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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