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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001795`

染色体: Chr01 坐标: 32821012-32823779 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001795`
名称	SmilChr01G001795
描述	uncharacterized SmilChr01G001795
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32821012 - 32823779 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006583`
GeneID	`131006583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006583`
原始查询	`LOC131006583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=22.5; qcov=0.439; evalue=7.17e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789729.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057789729.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057789729.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789729.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32821030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,D11
`Chr1:32821898`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A13,A24,B104,B27,B34,B38,B39,B40,B60,B62,C25,C28,C33,C44,C52,C58,C60,C63,C70,D3,D6
`Chr1:32821921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A9,B114,B26
`Chr1:32821921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B114,B26
`Chr1:32822059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr1:32822161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C3
`Chr1:32822185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B131
`Chr1:32822209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B65,D11
`Chr1:32822227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B131
`Chr1:32822248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B74,C39,C79
`Chr1:32822277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B89,D1
`Chr1:32822300`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A9,B113,B12,B137,B54,B55,B71,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789729.1

506 aa

253

506

DUF8566

PF29561 DUF8566 94-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789729.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	94	295	3.1e-51	174.8	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933746.1
ATGTCGAAAACGGTGTTTGGTGAAGGAGGTGATCCTGGTTCAAACGACCGTATGAACCGTGATGTTGAGCCTTCAAAAAAGACTAAATCAAAACGAGCTAGGGTGTCATCTGATGGACGTTCTACAGATATACCAGTTCCAGTTGTTGCTCCCGTCACAGAGGATGAAAGGTGTGAAGCAGCCATTGCAGCAAATGAATCTGTTGAGGTTGAAGATGTAACAGAACCAAATGACGGAAACAAGGATGATGGTGGGGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006583
ATGTCGAAAACGGTGTTTGGTGAAGGAGGTGATCCTGGTTCAAACGACCGTATGAACCGTGATGTTGAGCCTTCAAAAAAGACTAAATCAAAACGAGCTAGGGTGTCATCTGATGGACGTTCTACAGATATACCAGTTCCAGTTGTTGCTCCCGTCACAGAGGATGAAAGGTGTGAAGCAGCCATTGCAGCAAATGAATCTGTTGAGGTTGAAGATGTAACAGAACCAAATGACGGAAACAAGGATGATGGTGGGGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789729.1
MSKTVFGEGGDPGSNDRMNRDVEPSKKTKSKRARVSSDGRSTDIPVPVVAPVTEDERCEAAIAANESVEVEDVTEPNDGNKDDGGGDGFLVLHTRTTPSSFSSTMSKLNQNQKNAVIEMGFGHLLELNVRALPTKMAYWLLENFDHETGNLVIDDNVQIKVTEDDVYRVFGFPRGTEKINRFVYSACNALSLRWVQKFNVYNREHIKIKVVLAKMLADTDGGVWFRRHFIVALQFSLIESYPNGMVHPFVMRCLEDLGKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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