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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000541`

染色体: Chr01 坐标: 11118692-11121176 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000541`
名称	SmilChr01G000541
描述	ferritin-3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11118692 - 11121176 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006588`
GeneID	`131006588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006588`
原始查询	`LOC131006588`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferritin-3, chloroplastic-like
产物	ferritin-3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G40300` (FER4) ferritin 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818622] identity=69.6; qcov=0.956; evalue=3.64e-118; confidence=high
Rice	`Os12g0106000` (FER2) - identity=65.4; qcov=0.863; evalue=8.37e-100; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006826 (iron ion transport); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0006880 (GO:0006880); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008199 (ferric iron binding)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00210 (Ferritin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057789734.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057789734.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057789734.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789734.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11119084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:11119116`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr1:11119116`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr1:11120016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B9,C44
`Chr1:11120935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:11121067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B129,B60
`Chr1:11121089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789734.1

248 aa

124

248

Ferritin

PF00210 Ferritin 84-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789734.1`	Pfam	`PF00210`	Ferritin	Domain	84	228	2.2e-34	119.2	Ferritin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933751.1
ATCACTCATTTTCCTCCACATTTGGGTACACGAATCAAGTATGTTGCTCACAACGGCCTATTCACTGCTTCAGCCTCTCGCTCCTCGCCTCCTCCACGGCGGCGGAGATCTGTCTCTGCGGAGTCGGAAGGCTGGCTGTCTCGTCATGAACGCCTCCAGTGAAGCTAACAAACCGGCGATTATGAACGAGGTTTTCGAGCCGTTCGAGGAAGTGAAGAAGGAACTCCTTCTCGTCCCAACCGTTCCACACGCCTCCCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006588
ATGTTGCTCACAACGGCCTATTCACTGCTTCAGCCTCTCGCTCCTCGCCTCCTCCACGGCGGCGGAGATCTGTCTCTGCGGAGTCGGAAGGCTGGCTGTCTCGTCATGAACGCCTCCAGTGAAGCTAACAAACCGGCGATTATGAACGAGGTTTTCGAGCCGTTCGAGGAAGTGAAGAAGGAACTCCTTCTCGTCCCAACCGTTCCACACGCCTCCCTTGCTCGCCATGTCTACTCTGACCCCTGTGAAGCAGCCATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789734.1
MLLTTAYSLLQPLAPRLLHGGGDLSLRSRKAGCLVMNASSEANKPAIMNEVFEPFEEVKKELLLVPTVPHASLARHVYSDPCEAAINAQINVEYNVSYVYHAMYAYFDRDNVALKGLAKFFKEASVEEREHAEKFMEYQNKRGGQVNLHGMMMPISDYDHIDKGDALYAMELALSLEKLTNEKLLNLHKVADENNDAQLADFVESEFLAEQVESIKKISEYVAQLRRVGTGHGVWNFDQMLLAGATAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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