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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001797`

染色体: Chr01 坐标: 32828472-32830684 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001797`
名称	SmilChr01G001797
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32828472 - 32830684 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006589`
GeneID	`131006589`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006589`
原始查询	`LOC131006589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29.9; qcov=0.739; evalue=4.28e-57; confidence=low
Rice	`Os01g0852650` - identity=31.2; qcov=0.644; evalue=4.16e-55; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006589

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789735.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789735.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789735.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789735.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32828766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B139
`Chr1:32828825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,D11
`Chr1:32828844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B24
`Chr1:32828844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:32829000`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A13,A7,B1,B106,B118,B123,B125,B126,B139,B29,B35,B46,B78,B8,B87,B90,B92,B99,C2,C42,C52,C7,C71
`Chr1:32829004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:32829010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B51,B9,C38
`Chr1:32829053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:32829120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B101,B140
`Chr1:32829160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,D11
`Chr1:32829187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B103,B119,B74,B81
`Chr1:32829220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C27,C63,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789735.1

648 aa

324

648

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 11-106 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 188-307 aa PF10551 MULE 227-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789735.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	11	106	2.8e-13	51.1	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057789735.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	188	307	5.9e-10	39.9	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057789735.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	227	317	1.6e-25	90.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933752.1
ATGATATTTAGTACATTGCATGAAGCTGTTGAGTTTTACAAGGATTATGCCAAACTTTGTGGATTTGACACCCGAATGAGCACAAACAGGAAAAATAAAGATGATATAATTACCAGGCAATATGTGGTTTGTAAGAGAGAAGGAGTATGGAAAAAGGCAAAAGAACCTCGAGTGCGTTTCAGTGATAAGGGCACAAAGAAACGCAAGACAACATCTTGCAAGGTTGATTGTAAAGCTAAAGTTATAATTAAGATTGTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006589
ATGATATTTAGTACATTGCATGAAGCTGTTGAGTTTTACAAGGATTATGCCAAACTTTGTGGATTTGACACCCGAATGAGCACAAACAGGAAAAATAAAGATGATATAATTACCAGGCAATATGTGGTTTGTAAGAGAGAAGGAGTATGGAAAAAGGCAAAAGAACCTCGAGTGCGTTTCAGTGATAAGGGCACAAAGAAACGCAAGACAACATCTTGCAAGGTTGATTGTAAAGCTAAAGTTATAATTAAGATTGTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789735.1
MIFSTLHEAVEFYKDYAKLCGFDTRMSTNRKNKDDIITRQYVVCKREGVWKKAKEPRVRFSDKGTKKRKTTSCKVDCKAKVIIKIVLGNCYKFAEFWEGHTHSMVPLSTRDLMQSNRNVDEFQQRFIISGIKANIGPMRSFRMFREIMGSYDRVGCTSNDFKNFARDLKVHSKGSDAHMLLESFTNKQELGNGFKFFHDVDEENKLCRIIWADQTSIKNFSLFGEAVSFDATYNTNRYKLIFTPFTGKDNHGKCVSFGAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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