当前解析结果
SmilChr01G000559| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000559 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000559 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000559 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 11644323 - 11645990 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006603 |
|---|---|
| GeneID | 131006603 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006603 |
| 原始查询 | LOC131006603 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006603 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057789743.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057789743.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057789743.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057789743.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789743.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:11644602 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,C24,D10 |
Chr1:11644655 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,C67 |
Chr1:11644661 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,B6,B80 |
Chr1:11644665 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A5,B132,B31,B42,B43,B78,B99,C19,C47,C68,C77,C84,D2 |
Chr1:11644668 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B124,C56 |
Chr1:11644668 |
TTC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B124,C56 |
Chr1:11644687 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C56 |
Chr1:11644695 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,B53 |
Chr1:11644702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C22 |
Chr1:11644704 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr1:11644728 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A3,B126,B7,C1,C28,C41,C44,C61,C80 |
Chr1:11644749 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。