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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000583`

染色体: Chr01 坐标: 12597852-12601439 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000583`
名称	SmilChr01G000583
描述	GDSL esterase/lipase At1g06990-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	12597852 - 12601439 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006621`
GeneID	`131006621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006621`
原始查询	`LOC131006621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At1g06990-like
产物	GDSL esterase/lipase At1g06990-like
Arabidopsis	`AT1G06990` (AT1G06990) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837209] identity=53.3; qcov=0.92; evalue=2.12e-129; confidence=high
Rice	`Os01g0827700` (OsGELP26) - identity=48.2; qcov=0.934; evalue=1.6e-112; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057789781.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789781.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789781.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789781.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:12598472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B31,B6,D3
`Chr1:12598787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B129,B25,C80,D10
`Chr1:12598840`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B24,B68,C85
`Chr1:12598840`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B24,B68,C85
`Chr1:12598902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:12598937`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B51,B56,B59,B96
`Chr1:12598937`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B51,B56,B59,B96
`Chr1:12599109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789781.1

349 aa

174

349

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 29-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789781.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	29	339	1.1e-35	124.4	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933798.1
GACCCTTATTCCATATACAAACCACTTAATTATTTTATTAAAAATTGTGTCACTTCCAAATGAATACTAAAAGATGGGACTGGAGGAGTATGATTTAGTTCCTTCTTTTTGAGTGTTTGTATCAATAAAGCAACATATGTGAATTTGAATACATTATCCTTTGCATTGACATAATGCAGAAGATTGGAGAATTGAAGATTAATTTGCTATTAACTTGAATTCACAGTAAATCTGAACACATCTTAGAAGCGAAGAAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006621
ATGGTTCCTGCAGCCCTCTTGGCTTTGCTCATCACATTCACATTCACAGCAGCCTTGGGCAATCCCACACCCAAATTCCCAGCCATTCTTGCGTTTGGTGATTCAACAGTAGATACAGGCAACAACAACTACATCTTCACACCCTTCAAAGGCAACCACCGCCCTTACGGCCACAACTTCCCCGGTGCTGTCCCCACCGGAAGGTTCTCCAACGGGAGACTGGTGCCGGACATATTGGCATCCATGCTCGGCCTCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789781.1
MVPAALLALLITFTFTAALGNPTPKFPAILAFGDSTVDTGNNNYIFTPFKGNHRPYGHNFPGAVPTGRFSNGRLVPDILASMLGLKDAVPPFLDPLLSDQDIVSGVSFASAGSGYDDLTTSFSRVIPMSRQLDYLNDYVERLHTIVGEREAANILNRALVIVSAGTNDFTFNFYDFPTRRLQFTVSQYQNFLHAKLQSFIKVLYDVGCRKMVVSGLPPIGCLPIQMTVKSPLRRSCCQRENQDAEAYNDKLRKVLSQMEM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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