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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000581`

染色体: Chr01 坐标: 12292868-12297354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000581`
名称	SmilChr01G000581
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 23-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	12292868 - 12297354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006625`
GeneID	`131006625`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006625`
原始查询	`LOC131006625`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 23-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 23-like
Arabidopsis	`AT3G51950` (AT3G51950) Zinc finger (CCCH-type) family protein / RNA recognition motif (RRM)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824358] identity=76.4; qcov=0.675; evalue=2.2e-49; confidence=medium
Rice	`Os03g0329200` (OsC3H23) - identity=80.4; qcov=0.682; evalue=3.46e-54; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006625

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789784.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789784.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789784.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057789784.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057789784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:12292989`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A10,A11,A15,A22,A24,A3,A5,A6,A9,B1,B100,B107,B11,B111,B113,B117,B118,B122,B126,B132,B133,B135,B139,B14,B23,B27,B28,B35,B46,B47,B5,B53,B54,B55,B61,B65,B66,B67,B77,B82,B84,B89,B9,B93,C14,C18,C2,C21,C39,C4,C40,C44,C45,C5,C53,C55,C58,C61,C75,C78,C8,C80,C84,C85
`Chr1:12293014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr1:12293017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B44,B58,C51,C74
`Chr1:12293019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr1:12293027`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	61	A10,A11,A15,A22,A24,A3,A5,A6,A9,B1,B100,B107,B11,B111,B113,B117,B118,B132,B133,B135,B138,B139,B14,B23,B27,B28,B35,B38,B5,B55,B61,B65,B66,B67,B70,B77,B82,B86,B9,B90,B93,C13,C14,C18,C2,C21,C39,C4,C40,C44,C45,C5,C53,C55,C58,C75,C78,C8,C80,C84,C85
`Chr1:12293065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:12293081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B9,C44
`Chr1:12293082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:12293091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B53,B63,C61
`Chr1:12293100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B129,B25,C80
`Chr1:12293135`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A18,A21,A4,B108,B110,B111,B120,B124,B127,B131,B140,B16,B22,B4,B51,B56,B59,B6,B8,B85,B86,B88,B96,C22,C23,C26,C36,C37,C46,C62,C67,C76
`Chr1:12293148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B9,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789784.1

157 aa

157

RRM_1

PF00076 RRM_1 19-59 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789784.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	19	59	5.5e-05	23.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095637.1
ATTCCGTATCACCCACGCCTCAATACGTGAGGGCCACATCTTTCCTGCAGCTATATTTATCATATTCACTTTACCTCAACTCTATCCTATGTCCCTAATAGGTAATATACAAAACATCTACAAAACGCAAATCCTTTTCAGCAGACCTTTCTGACCTCTCCTCAACAGCGACTGGAGTTCGTTCAATGGGACCAAGACATCACAGTCCTTGATATGCCACAATGTGATATAAATGTTGAAGTTACGGTTGCAACCACAGT...

XR_009095636.1
TACCTCAACTCTATCCTATGTCCCTAATAGGTAATATACAAAACATCTACAAAACGCAAATCCTTTTCAGCAGACCTTTCTGACCTCTCCTCAACAGCGACTGGTAACTTTATTATTCTGTAAATTTTCATGATTTTAATTCAGCAAAACAAAAGCTATTGCTTCTATTTTATTCTTCATTTATCCTATACAGAAATGCAACAAATCCAATCGCATACAAAACCACAACAGATAGGCATCTCAAATTCTCAATTCTTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006625
ATGAATAATCCTGGGTCGAGGCAGATTTACTTGACATTCCCTGCTGATAGCACCTTTAAGGAGGAGGATGTGTCCACTTATTTTAGTAATTTTGGACCGGTTCAAGATGTAAGGATCCCATATCAGCAGAAGAGGATGTTTGAGTTCGTCACCTTCGACTTCTCGGAGACTGTGAAGCCCATTCTCGCCAAGGGAAACCCTCATTTTCTCTGCGATGCCCGGGTGCTCGTGAAGCCTTACAAAGAGAAAGGGAAGATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789784.1
MNNPGSRQIYLTFPADSTFKEEDVSTYFSNFGPVQDVRIPYQQKRMFEFVTFDFSETVKPILAKGNPHFLCDARVLVKPYKEKGKIPDKHRKQQQDLASSPTGTDPHALLAAVATAGAAPSVISAVVSENHSCADGDEREREKEKEVRESLNYIYKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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