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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001846`

染色体: Chr01 坐标: 33415115-33415759 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001846`
名称	SmilChr01G001846
描述	uncharacterized SmilChr01G001846
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33415115 - 33415759 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006672`
GeneID	`131006672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006672`
原始查询	`LOC131006672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase THETA 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834125]; symbol=GSTT2; hit=AT5G41240; species=arabidopsis; confidence=low
产物	glutathione S-transferase THETA 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834125]; symbol=GSTT2; hit=AT5G41240; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41240` (GSTT2) glutathione S-transferase THETA 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834125] identity=30; qcov=0.654; evalue=3.32e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789821.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789821.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789821.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789821.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789821.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33415121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C34
`Chr1:33415122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:33415128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	B107,B123,B140,B27,B34,B38,B44,B45,B57,B67,B76,B86,C31,C50,C52,C7,C72,C8,C84,D3
`Chr1:33415129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A10,A11,A16,A19,A21,B10,B11,B112,B138,B2,B29,B37,B42,B47,B50,B69,B72,B83,B85,B88,B91,B99,C30,C37,C5,C84,D5
`Chr1:33415149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C24
`Chr1:33415153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B64,C32,C4,C68
`Chr1:33415171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:33415206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:33415248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C69
`Chr1:33415265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D7
`Chr1:33415265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:33415289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B12,B22,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789821.1

214 aa

107

214

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 59-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789821.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	59	186	1.3e-07	33.4	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933838.1
ATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAATGAAAATGCAAACAAATGGGTTGCTGCTTGCAGGGAGGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGAATGAGCGACAACGATGTTGAGAAAGAAGCTCATTCCATTTACGAAGCAGGTGGGAGCAAGTTTCAAGATTTGGTTGTATTTAATGAAGTTATGAGTAAACATCCCAAGTGGAATGTTTATGATACAACACCAATTTTTCCTCATGCAAGTGAAGATGTTGATAACCATGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006672
ATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAATGAAAATGCAAACAAATGGGTTGCTGCTTGCAGGGAGGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGAATGAGCGACAACGATGTTGAGAAAGAAGCTCATTCCATTTACGAAGCAGGTGGGAGCAAGTTTCAAGATTTGGTTGTATTTAATGAAGTTATGAGTAAACATCCCAAGTGGAATGTTTATGATACAACACCAATTTTTCCTCATGCAAGTGAAGATGTTGATAACCATGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789821.1
MKGRWKRLNENANKWVAACREANARRRSGMSDNDVEKEAHSIYEAGGSKFQDLVVFNEVMSKHPKWNVYDTTPIFPHASEDVDNHESGGSSKRSKTSEDGGFSVPSNPETPTSEQSTATRPIGRDKAKRKGKGKASQSESTNESVVAAEIRAMRLTRDAETELIKTRIELEREKLQRNAMKIKEKMLLQLLAKDHLSPEDEEMKRQLTKIVFGE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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