当前解析结果
SmilChr01G000658| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000658 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000658 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000658 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 14687170 - 14689566 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006674 |
|---|---|
| GeneID | 131006674 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006674 |
| 原始查询 | LOC131006674 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0307900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0307900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0307900- identity=26; qcov=0.547; evalue=1.17e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006674 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789824.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057789824.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057789824.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789824.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789824.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:14687712 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B14,B37,B75,B90 |
Chr1:14687750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C23 |
Chr1:14687758 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:14687771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B44,B70,C19,C20,C62 |
Chr1:14687826 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C23 |
Chr1:14687845 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,C25,C35,C61 |
Chr1:14687857 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C1 |
Chr1:14687869 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr1:14687932 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A5,C20,C74,C86 |
Chr1:14687937 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:14687955 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,C74 |
Chr1:14687960 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。