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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001851`

染色体: Chr01 坐标: 33435244-33436787 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001851`
名称	SmilChr01G001851
描述	uncharacterized SmilChr01G001851
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33435244 - 33436787 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006698`
GeneID	`131006698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006698`
原始查询	`LOC131006698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=26.3; qcov=0.581; evalue=9.93e-20; confidence=low
Rice	`Os10g0351414` - identity=22.4; qcov=0.805; evalue=4.89e-18; confidence=weak
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789837.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057789837.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057789837.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789837.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33435244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:33435265`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B91,C21,C44
`Chr1:33435265`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B91,C21,C44
`Chr1:33435271`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B91,C44
`Chr1:33435271`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B91,C44
`Chr1:33435290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A10
`Chr1:33435290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:33435318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A3,A6,B102,B108,B11,B124,B130,B131,B135,B137,B25,B56,B59,B75,B79,C19,C20,C23,C31,C36,C39,C4,C61,C66,C77,D10
`Chr1:33435323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B125,C41
`Chr1:33435343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B19
`Chr1:33435366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A23,B119,B127,B139,B22,B29,B41,B58,B6,B64,B81,C24,C52,C6,C76,C79,C82,C83
`Chr1:33435367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789837.1

472 aa

236

472

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 51-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789837.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	51	268	8.5e-12	46.0	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933854.1
ATGGGGCCAATGAGGCGTGTGAGTACGGAATTCAGGCGAGACAAGGCCAAGAGCAATACGCTGAGGAGGGCAGGGACATCTGGAATTTTGGCAAAAAAACTTAGATTATCAACCGATCTTAATGATGCAGTTATGGAGGAGCAATTTAGAGGCTTGGGGAGCTCTGCGAAGAAACGAGATGTCCGGCATGTTATTGGACAGCAGCGAGTCGACCTATGCTTTATCCAGGAAACAAAAATGGAATCCATGGAGGGAGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006698
ATGGGGCCAATGAGGCGTGTGAGTACGGAATTCAGGCGAGACAAGGCCAAGAGCAATACGCTGAGGAGGGCAGGGACATCTGGAATTTTGGCAAAAAAACTTAGATTATCAACCGATCTTAATGATGCAGTTATGGAGGAGCAATTTAGAGGCTTGGGGAGCTCTGCGAAGAAACGAGATGTCCGGCATGTTATTGGACAGCAGCGAGTCGACCTATGCTTTATCCAGGAAACAAAAATGGAATCCATGGAGGGAGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789837.1
MGPMRRVSTEFRRDKAKSNTLRRAGTSGILAKKLRLSTDLNDAVMEEQFRGLGSSAKKRDVRHVIGQQRVDLCFIQETKMESMEGEMCNGWWGRNNYGLARRDAEGRSGGILCAWNKDHFTATSSWDMQGAVIINGVGKAGNLSYCLINVYASNVAREKAESWDKLQILAEQNRDRCLCIMGDFNAIRERGERVGKSENFDTADMRRFDAFIRDSELTEVRTQGRKFTWYQANGRCKSKLDRFLVNNCWLDSWPSTVERC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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